RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 OR10J3Q5JRS4 329 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 FABP5P3A8MUU1 101 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 LINC01556Q5JQF7 62 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 ZNF506Q5JVG8 444 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 RNF222A6NCQ9 220 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 A8MWV9 139 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 ASIPP42127 132 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 DPPA3Q6W0C5 159 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 OR2T35Q8NGX2 323 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 HIST1H2BAQ96A08 127 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 APOBP04114 4563 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 EPM2AB3EWF7 344 aa10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-206ENST00000431413 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 PEX7O00628 323 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
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HERC3-206ENST00000431413 LINC00479Q96M42 142 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC3-206ENST00000431413 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.2□□□□□ -0.78
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HERC3-206ENST00000431413 ZNF726P1Q15940 193 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 SYT8Q8NBV8 401 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 ZFP30Q9Y2G7 519 aa10.2□□□□□ -0.78
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HERC3-206ENST00000431413 B4DEV8 164 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3-30P01768 117 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3-33P01772 117 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 UBE2G1P62253 170 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 Q86TA4 180 aa10.19□□□□□ -0.78
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HERC3-206ENST00000431413 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 PARLQ9H300 379 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 Q9HAA7 133 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 IL36BQ9NZH7 164 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 ARPC5O15511 151 aa10.18□□□□□ -0.78
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HERC3-206ENST00000431413 LAGE3Q14657 143 aa10.18□□□□□ -0.78
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HERC3-206ENST00000431413 TCEAL7Q9BRU2 100 aa10.18□□□□□ -0.78
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HERC3-206ENST00000431413 A0A087WWC5 75 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 GAGE12JA6NER3 117 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 RHODO00212 210 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 XGP55808 180 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP10-1P60331 282 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 GAGE1Q13065 139 aa10.17□□□□□ -0.78
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HERC3-206ENST00000431413 RGS21Q2M5E4 152 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 GAGE13Q4V321 117 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 TOR2AQ5JU69 321 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 DNLZQ5SXM8 178 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 FAM162BQ5T6X4 162 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 LRCOL1A6NCL2 159 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 KRBOX1C9JBD0 128 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 H3BVH4 76 aa10.15□□□□□ -0.78
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HERC3-206ENST00000431413 CST9LP1Q5W188 147 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 Q6ZSN1 163 aa10.15□□□□□ -0.78
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HERC3-206ENST00000431413 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC3-206ENST00000431413 SH2D1AO60880 128 aa10.14□□□□□ -0.79
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HERC3-206ENST00000431413 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.14□□□□□ -0.79
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HERC3-206ENST00000431413 SEC11BP0C7V7 166 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-206ENST00000431413 LINC00694P0DN24 101 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-206ENST00000431413 AKR1C3P42330 323 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-206ENST00000431413 CRIP1P50238 77 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-206ENST00000431413 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-206ENST00000431413 UFSP1Q6NVU6 142 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-206ENST00000431413 TMEM70Q9BUB7 260 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-206ENST00000431413 JPT2Q9H910 190 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC3-206ENST00000431413 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.13□□□□□ -0.79
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