RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 NDUFA4O00483 81 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 HERVK_113P63121 156 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 LINC01619G3V211 115 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 TAX1BP3O14907 124 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00311Q8N616 119 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 CR1LQ2VPA4 569 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 LINC01545Q5VT33 79 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 hADV29S1A0JD25 119 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 DENND4CQ5VZ89 1909 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 PTPN13Q12923 2485 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 IGHV1-69P01742 117 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM258P61165 79 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 SPRY4Q9C004 299 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 DYSFO75923 2080 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 PRSS47A8MTI9 375 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 A4D1N5 150 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 XCL1P47992 114 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 IGLV1-44P01699 117 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 GTSF1Q8WW33 167 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 IGF2RP11717 2491 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 GATA3P23771 443 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 C5orf47Q569G3 176 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 NRGNQ92686 78 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 A0A0J9YXV3 536 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 RBAKDNA6NC62 111 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 NDUFC2O95298 119 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 PATE2Q6UY27 113 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 DAND5Q8N907 189 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 DKK4Q9UBT3 224 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 GP9P14770 177 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 SPRNQ5BIV9 151 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 TEN1Q86WV5 123 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 NDUFS5O43920 106 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 CGB3P0DN86 165 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 WISP2O76076 250 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1B0GX51 115 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 RHOHQ15669 191 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 FOXI1Q12951 378 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 C5orf38Q86SI9 138 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 LINC01620Q4KN68 170 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 RITA1Q96K30 269 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 PTH2Q96A98 100 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 U3KQE9 123 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 CTSZQ9UBR2 303 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 EML6Q6ZMW3 1958 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 MED13Q9UHV7 2174 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 CGB7P0DN87 165 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 Q8NFD4 153 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 C22orf46C9J442 243 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 G3V4G9 280 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 ACYP1P07311 99 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.27□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 Q6ZQT7 251 aa11.27□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa11.27□□□□□ -0.6
PTPRU-204ENST00000428026 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 A0A0J9YY99 117 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 Q8NA96 180 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 J3KT08 172 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 IGHG2P01859 326 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 CLEC2BQ92478 149 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 A0A0B4J2C4 111 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 PRORYQ9H606 182 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 IGKV1-17P01599 117 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 APOC4P55056 127 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 RMI2Q96E14 147 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 I3L2K1 104 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms