RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM191AQ9H0A3 160 aa2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 GNRH2O43555 120 aa2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB4AP20338 218 aa2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 EVI2AP22794 236 aa2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 EBLN2Q6P2I7 272 aa2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 FA2HQ7L5A8 372 aa2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 C4orf3Q8WVX3 66 aa2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 CNFNQ9BYD5 112 aa2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 C19orf73Q9NVV2 129 aa2.98□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 CBY3A6NI87 242 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 M0R381 172 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 GAS8-AS1O95177 125 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 LEPROTL1O95214 131 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 CD28P10747 220 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00173Q6ZV60 143 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 OR9G4Q8NGQ1 327 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF185Q96GF1 192 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM19A4Q96LR4 140 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 AP5S1Q9NUS5 200 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 PEMTQ9UBM1 199 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 PAM16Q9Y3D7 125 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 AGRNO00468 2067 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0J9YX75 114 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 NPYP01303 97 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5AL1P0C617 328 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ASIPP42127 132 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 FXYD7P58549 80 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM159AQ6UWV7 190 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ATOH7Q8N100 152 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N976 141 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01006Q8NI28 216 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 KLLNB2CW77 178 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 H0Y8G0 127 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 SNAI2O43623 268 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 DDTP30046 118 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB131AP59861 70 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 SCGB2A2Q13296 93 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 SPINK13Q1W4C9 94 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 APRG1Q8IVJ8 170 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM61Q8N0U2 210 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 VAMP8Q9BV40 100 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 U3KQK5 164 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 KNCNA6PVL3 124 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TCF21O43680 179 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 LY6G6DO95868 133 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFA6Q01524 100 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF151Q2KHN1 245 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX43Q6ZNM6 134 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RAX2Q96IS3 184 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C7orf71A4D174 169 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 CCL24O00175 119 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 PPBPP02775 128 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 CD7P09564 240 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 LEPP41159 167 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 CDKN1BP46527 198 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNG7P62955 275 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM70Q9BUB7 260 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB114Q30KQ6 69 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXI2Q6ZQN5 318 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 HTN1P15515 57 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPOP30536 169 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 HILS1P60008 231 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4C46A6NHA9 309 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 MGPP08493 103 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA45Q537H7 98 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR2DL5AQ8N109 375 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2K2Q8NGT1 345 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C14orf144Q96I85 54 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms