RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 NXPH4O95158 308 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 INSP01308 110 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 ESDP10768 282 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 PTH2Q96A98 100 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 NAGKQ9UJ70 344 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 U3KQK5 164 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 M0R2Z0 102 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV3-20P01619 116 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 S100A2P29034 98 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 SRIP30626 198 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 KIR3DS1Q14943 382 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 SYT8Q8NBV8 401 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf85Q96MD7 179 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 H3BVH4 76 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 GNRH2O43555 120 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 CD7P09564 240 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 MUC21Q5SSG8 566 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 BAGE3Q86Y29 109 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 ORMDL3Q8N138 153 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 PPP1R17O96001 155 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZQT7 251 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM18Q96B42 140 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 SPXQ9BT56 116 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 CBY3A6NI87 242 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 RAB4AP20338 218 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 PMCHP20382 165 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF124Q15973 351 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 AMN1Q8IY45 258 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 Q8N1Y9 231 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB125Q8N687 156 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 MRAP2Q96G30 205 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 AP1S3Q96PC3 154 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS47A8MTI9 375 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 M0R381 172 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 CKS2P33552 79 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF415Q09FC8 603 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 RNF185Q96GF1 192 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 PRELID3AQ96N28 172 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01587Q99440 93 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 TENM3Q9P273 2699 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM17P0DL12 118 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 D6R8Y8 96 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 M0R2P5 195 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 SERF1AO75920 110 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00614P0C842 121 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 EVI2AP22794 236 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 FXYD7P58549 80 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 NIT1Q86X76 327 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 CSTL1Q9H114 145 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 MDFICQ9P1T7 246 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 XCL2Q9UBD3 114 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01546A6NGU7 62 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 IFITM10A6NMD0 228 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 A8MWV9 139 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 AKR1D1P51857 326 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 C20orf78Q9BR46 151 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms