RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HERC3-202ENST00000402738 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1-17P01599 117 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-202ENST00000402738 PSMB8P28062 276 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-202ENST00000402738 CFHR3Q02985 330 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-202ENST00000402738 DTX1Q86Y01 620 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-202ENST00000402738 XCL2Q9UBD3 114 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-202ENST00000402738 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-202ENST00000402738 F8WEM9 126 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-202ENST00000402738 COX6B1P14854 86 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-202ENST00000402738 A0A0G2JNJ9 132 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 IGHG2P01859 326 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 Q9UFV3 132 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 NBL1P41271 181 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 TM2D2Q9BX73 214 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 TOMM6Q96B49 74 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 E7EQL1 145 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 PIFOQ8TCI5 191 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 DEFB130BP0DP73 79 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 DEFB130AP0DP74 79 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 CD59P13987 128 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 MED13Q9UHV7 2174 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.63□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 LINC00643Q86TS7 51 aa7.63□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.63□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 UQCRQO14949 82 aa7.63□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 CDK2AP2O75956 126 aa7.63□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 ACACAQ13085 2346 aa7.63□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 COL4A6Q14031 1691 aa7.63□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 CCDC179H3BU77 68 aa7.63□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 I3L2K1 104 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 IGLC6P0CF74 106 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZPA2 131 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 RITA1Q96K30 269 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 SPATA25Q9BR10 227 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 PRAC2D3DTV9 90 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 NDUFA4O00483 81 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 INSL3P51460 131 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 OBSL1O75147 1896 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 THADAQ6YHU6 1953 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 K7EIM0 57 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 DAD1P61803 113 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.62□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 XGP55808 180 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 MBD6Q96DN6 1003 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 ATP5G1P05496 136 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 UBE2E1P51965 193 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 SPRNQ5BIV9 151 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 ABCA4P78363 2273 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 hADV29S1A0JD25 119 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 E7EUB6 86 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 IGLV1-44P01699 117 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 P0C879 139 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 H0YGX0 51 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 LECT2O14960 151 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 LINC00310P59036 64 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 Q9HAA7 133 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 COL4A3Q01955 1670 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 A0A0U1RQV1 116 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-202ENST00000402738 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.59□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.59□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.59□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 TIMM17AQ99595 171 aa7.59□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 C20orf197Q8N268 126 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 ALPK3Q96L96 1907 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 Q8N976 141 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 COX7B2Q8TF08 81 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 CTSZQ9UBR2 303 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms