RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384269.1

RNU6-842P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 842, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-842P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-842P-201ENST00000384269 CARD19Q96LW7 228 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-842P-201ENST00000384269 PLCE1Q9P212 2302 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-842P-201ENST00000384269 MYH1P12882 1939 aa-1.28□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 LRP5O75197 1615 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 GABARAPH6UMI1 98 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 ACYP2P14621 99 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 TEX29Q8N6K0 151 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 Q96NJ1 140 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 GINS3Q9BRX5 216 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 FAT1Q14517 4588 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 TECPR2O15040 1411 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 SPRR1AP35321 89 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 REEP5Q00765 189 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 MORN4Q8NDC4 146 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 OR4S1Q8NGB4 309 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 PTPRGP23470 1445 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 MFSD11O43934 449 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 IFNA1P01562 189 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 TFF1P04155 84 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 SPINK8P0C7L1 97 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 TMED2Q15363 201 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 OTOSQ8NHW6 89 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 NF1P21359 2839 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 H3BMG7 143 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 CTXN2P0C2S0 81 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 INSL4Q14641 139 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 C4orf33Q8N1A6 199 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 DYDC1Q8WWB3 177 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 SPTA1P02549 2419 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 CRYGSP22914 178 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 FAM24BQ8N5W8 94 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 LXNQ9BS40 222 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 PARVGQ9HBI0 331 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 BATF3Q9NR55 127 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 S100A11P31949 105 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 HBDP02042 147 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 PCBD1P61457 104 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 V9GYV3 84 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 MYH3P11055 1940 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 PPP5D1E7EU14 171 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 CCL3L1P16619 93 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 AKR1D1P51857 326 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 TCTAP57738 103 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 GNG3P63215 75 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 OR8B8Q15620 311 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 BRK1Q8WUW1 75 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEGS1O15121 323 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 HSD11B1P28845 292 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 OR2T2Q6IF00 324 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 STX19Q8N4C7 294 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 LOC730098B7Z3J9 87 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 CRYBA4P53673 196 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 SMIM20Q8N5G0 67 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 COX7B2Q8TF08 81 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 CHD8Q9HCK8 2581 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 USF3Q68DE3 2245 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 PLXNA2O75051 1894 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 WDR97A6NE52 1622 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 PKHD1P08F94 4074 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 M0QZK8 103 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 C3orf33Q6P1S2 294 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 SLC25A26Q70HW3 274 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 NDUFA11Q86Y39 141 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-842P-201ENST00000384269 GOLGA3Q08378 1498 aa-1.39□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms