RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 ZFP82Q8N141 532 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 FAM210BQ96KR6 192 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 SPXQ9BT56 116 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 SORL1Q92673 2214 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 K7EIL1 84 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 M0R381 172 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 SPRY2O43597 315 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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PTPRK-201ENST00000368202 CAMPP49913 170 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRK-201ENST00000368202 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-201ENST00000368202 MDFICQ9P1T7 246 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRK-201ENST00000368202 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 MRAPQ8TCY5 172 aa8.83□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 RNF183Q96D59 192 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 PRM2P04554 102 aa8.82□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.82□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 YPEL4Q96NS1 127 aa8.82□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 HLA-DQA1P01909 254 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 MT-ND6P03923 174 aa8.81□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 RAB5AP20339 215 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF575Q86XF7 245 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 FRZBQ92765 325 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 AP1S3Q96PC3 154 aa8.81□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 EMP1P54849 157 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF876PQ49A33 203 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GXF2 115 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 PTH2Q96A98 100 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRK-201ENST00000368202 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.77□□□□□ -1.01
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PTPRK-201ENST00000368202 RETNQ9HD89 108 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 FBN3Q75N90 2809 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 EVI2AP22794 236 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
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PTPRK-201ENST00000368202 LYRM9A8MSI8 78 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 F5H697 171 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 RHODO00212 210 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE7O76087 117 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 TRGC2P03986 189 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE12FP0CL80 117 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE12GP0CL81 117 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE12IP0CL82 117 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF56Q15929 161 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 AMN1Q8IY45 258 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 Q8NAQ8 132 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.75□□□□□ -1.01
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