RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358966.6

GGPS1-202, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GGPS1, Length 2,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-202ENST00000358966 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
GGPS1-202ENST00000358966 H3BMG7 143 aa9.65□□□□□ -0.86
GGPS1-202ENST00000358966 CCDC179H3BU77 68 aa9.65□□□□□ -0.86
GGPS1-202ENST00000358966 LTAP01374 205 aa9.65□□□□□ -0.86
GGPS1-202ENST00000358966 SMIM13P0DJ93 91 aa9.65□□□□□ -0.86
GGPS1-202ENST00000358966 SRD5A1P18405 259 aa9.65□□□□□ -0.86
GGPS1-202ENST00000358966 METTL26Q96S19 204 aa9.65□□□□□ -0.86
GGPS1-202ENST00000358966 PSMB8P28062 276 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 TCTAP57738 103 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 MLST8Q9BVC4 326 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 JMJD1CQ15652 2540 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 ERCC8Q13216 396 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 FMC1Q96HJ9 113 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GAGE12JA6NER3 117 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GAGE7O76087 117 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GAGE12FP0CL80 117 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GAGE12GP0CL81 117 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GAGE12IP0CL82 117 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GAGE4Q13068 117 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 FHL3Q13643 280 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 DEFB136Q30KP8 78 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GTSF1Q8WW33 167 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 OSTCQ9NRP0 149 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 CHEK1O14757 476 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 C5orf47Q569G3 176 aa9.63□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 K7ERJ3 54 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 DUX3Q96PT4 197 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 ESM1Q9NQ30 184 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 Q6AWC8 147 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 APOMO95445 188 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 CRIP1P50238 77 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 AMTNQ6UX39 209 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 USMG5Q96IX5 58 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 PDE6HQ13956 83 aa9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GLMPQ8WWB7 406 aa9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 VCX2Q9H322 139 aa9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 A0A1B0GWB2 263 aa9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 HIGD1CA8MV81 97 aa9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 FOXI1Q12951 378 aa9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GAGE13Q4V321 117 aa9.61□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 LINC01545Q5VT33 79 aa9.61□□□□□ -0.87
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GGPS1-202ENST00000358966 TEX29Q8N6K0 151 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 NUP35Q8NFH5 326 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 P01737 135 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 CAMPP49913 170 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 Q6ZQT7 251 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 U3KQE9 123 aa9.6□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 H3BUA1 57 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 NDUFA4O00483 81 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 GCSHP23434 173 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 CSN1S1P47710 185 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 FXYD2P54710 66 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 C20orf173Q96LM9 149 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGPS1-202ENST00000358966 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGPS1-202ENST00000358966 VWFP04275 2813 aa9.59□□□□□ -0.88
GGPS1-202ENST00000358966 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.58□□□□□ -0.88
GGPS1-202ENST00000358966 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.58□□□□□ -0.88
GGPS1-202ENST00000358966 A0A087WW49 117 aa9.58□□□□□ -0.88
GGPS1-202ENST00000358966 CT45A10P0DMU9 189 aa9.58□□□□□ -0.88
GGPS1-202ENST00000358966 PTH2Q96A98 100 aa9.58□□□□□ -0.88
GGPS1-202ENST00000358966 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.58□□□□□ -0.88
GGPS1-202ENST00000358966 FOXC2Q99958 501 aa9.58□□□□□ -0.88
GGPS1-202ENST00000358966 TPPP3Q9BW30 176 aa9.58□□□□□ -0.88
GGPS1-202ENST00000358966 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.58□□□□□ -0.88
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