RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 K7EQD1 137 aa7.42□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.42□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 SVIPQ8NHG7 77 aa7.42□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.42□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 SIVA1O15304 175 aa7.42□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 IL15RAQ13261 267 aa7.42□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.42□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 MLANAQ16655 118 aa7.41□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.41□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.41□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.41□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 Q9H8V8 135 aa7.41□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 CCL24O00175 119 aa7.41□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.41□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 A0A096LPF7 62 aa7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 ETDBQ3ZM63 59 aa7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 Q6ZVH6 145 aa7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 COX7A2LO14548 114 aa7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.4□□□□□ -1.22
CUX1-201ENST00000292535 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.4□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 PRR25Q96S07 402 aa7.4□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 CRYGCP07315 174 aa7.4□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.4□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 SEC61GP60059 68 aa7.4□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 C14orf177Q52M58 125 aa7.4□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 IL17DQ8TAD2 202 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 NDUFC2O95298 119 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 FOXE3Q13461 319 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 LINC00479Q96M42 142 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 GYPEP15421 78 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 TM2D2Q9BX73 214 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 A0A1B0GX51 115 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 QRFPP83859 136 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 CRYBA4P53673 196 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 NPYP01303 97 aa7.39□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 LTAP01374 205 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 Q6ZQT7 251 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 NDUFA1O15239 70 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 K7EP13 123 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 A0A0J9YY99 117 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PPM0 123 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 LINC00205P59089 165 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 GP9P14770 177 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 VOPP1Q96AW1 172 aa7.38□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 IGHG2P01859 326 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 K7EM74 188 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 FXYD5Q96DB9 178 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 ATP5G1P05496 136 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 IGLC2P0DOY2 106 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 IGLC3P0DOY3 106 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 IGLV1-44P01699 117 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 Q6ZRM9 215 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 PYY3Q5JQD4 70 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 NDUFS7O75251 213 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 IGHV2-5P01817 119 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 LINC01620Q4KN68 170 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 Q9HAA7 133 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 U3KQE9 123 aa7.37□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 ACYP1P07311 99 aa7.36□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.36□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.36□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 BAALCQ8WXS3 180 aa7.36□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 F8W735 103 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 PROP1O75360 226 aa7.36□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 CXCL5P42830 114 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 C15orf65H3BRN8 121 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 NPBQ8NG41 125 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 TIMM17AQ99595 171 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 C12orf74Q32Q52 190 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-201ENST00000292535 C11orf52Q96A22 123 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms