RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 C17orf77Q96MU5 243 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 DKK2Q9UBU2 259 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFA1O15239 70 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0J9YXY3 114 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 H3BT86 120 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 CRYGBP07316 175 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 Q9H8V8 135 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 LYRM9A8MSI8 78 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0B4J2C4 111 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0J9YX75 114 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 CFHR3Q02985 330 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 A0A087WW49 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 IGLL5B9A064 214 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 C10orf142B7Z368 130 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 SPRNQ5BIV9 151 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 Q6YL49 198 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GXF2 115 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 SLURP1P55000 103 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 KNL1Q8NG31 2342 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 BAALCQ8WXS3 180 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 MUC7Q8TAX7 377 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 GYPEP15421 78 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N1Y9 231 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM258P61165 79 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 LY6LH3BQJ8 138 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 A4D1N5 150 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01620Q4KN68 170 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 NCKAP5O14513 1909 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 GTSF1Q8WW33 167 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 RITA1Q96K30 269 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 Q8NA96 180 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 ATOX1O00244 68 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 U3KQK5 164 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 TIRAPP58753 221 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 IGLC6P0CF74 106 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 PRO0255Q9UI72 69 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 LMO4P61968 165 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-201ENST00000261266 F6UB75 175 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFB1O75438 58 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 XCL1P47992 114 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 UBE2BP63146 152 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF580Q9UK33 172 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 TEN1Q86WV5 123 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 MORN5Q5VZ52 161 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 NXPH4O95158 308 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 ODF1Q14990 250 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC140Q96MF4 163 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 TIMM17BO60830 172 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 BRI3O95415 125 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 MIAQ16674 131 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 DIRC1Q969H9 104 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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