RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp976E9Q981 636 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20873J3QMQ9 232 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20795J3QP49 232 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ly6c1P0CW02 131 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 ApcsP12246 224 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm21440Q3TTD8 232 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lrfn3Q8BLY3 626 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Aadacl4Q8BM81 407 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr76Q8VFV2 317 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem126bQ9D1R1 230 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mbnl1Q9JKP5 341 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ighv7-3A0A075B5R2 120 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bmp5P49003 452 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 CxadrP97792 365 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arrdc5Q497K5 325 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sap30lQ5SQF8 182 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr399Q7TRX3 311 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lhfpl1Q80SV1 220 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rnd1Q8BLR7 232 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bpifa5Q9CQX3 270 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ssbp2Q9CYZ8 361 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Frrs1lB1AXV0 293 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr918E9PVZ7 325 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 1700003H04RikE9PXM2 192 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cd3eP22646 189 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr15P23275 312 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr924Q7TRB8 308 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr823Q7TRH2 315 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pef1Q8BFY6 275 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem11Q8BK08 190 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr523Q8VFE7 317 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr824Q8VFU4 315 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam241aQ9CZL2 131 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cmtm2bQ9DAC0 210 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kcnk5Q9JK62 502 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Opn3Q9WUK7 400 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ash1lQ99MY8 2958 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ighv4-1A0A075B5R5 116 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Inafm1E9PV59 130 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Foxl2O88470 375 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp58P16372 489 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 EtdQ80SW5 59 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 VsirQ9D659 308 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr972Q9EQA2 314 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sumo3Q9Z172 110 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r224E9PWK2 298 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 P01655 112 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 H2-DMb2Q31099 261 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 G430049J08RikQ3TL09 166 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 RnasekQ8K3C0 98 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mrps36Q9CQX8 102 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tppp3Q9CRB6 176 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pcsk5Q04592 1877 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm26965M0QWH4 86 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mtnd6P03925 172 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm9945Q8BNZ3 91 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nrn1Q8CFV4 142 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr476Q8VGI4 310 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1258Q8VGN6 311 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 EpcamQ99JW5 315 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 FibinQ9CQS3 217 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ctnnbip1Q9JJN6 81 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp930A0A1D5RM15 441 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wt1P22561 449 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ube2g1P62254 170 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Klf14Q19A41 325 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ndufv3Q8BK30 104 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc31a2Q9CPU9 143 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem183Q9JJB9 375 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1293-psA0A1L1SVB5 326 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Trav12d-1A0N8R0 115 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 AgerQ62151 402 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hes7Q8BKT2 225 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc37a1Q8R070 531 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 CcsQ9WU84 274 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tns1E9Q0S6 1888 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kdf1A2A9F4 397 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 ErhP84089 104 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cdkn2aQ64364 169 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1472Q7TQQ9 314 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rnf182Q8C432 247 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr484Q8VFD3 321 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Znf672Q99LH4 468 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cbln3Q9JHG0 197 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rnf7Q9WTZ1 113 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r61W4VSP5 300 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cldn34c3J3QJW5 233 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cldn34c2J3QNM1 233 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm15292L7N231 93 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Klrd1O54707 179 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tpsb2P21845 276 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bmpr1bP36898 502 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 CebpdQ00322 268 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 SriQ6P069 198 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1246Q7TQZ6 314 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Q8C708 225 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cldn34c1Q8K193 234 aa9.47□□□□□ -0.89
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1228Q8VGM9 323 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.6 ms