RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	TVP23C	Q96ET8	276 aa		3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	BTF3L4	Q96K17	158 aa		3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00477	Q96M19	166 aa		3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ENY2	Q9NPA8	101 aa		3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	DOK5	Q9P104	306 aa		3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MAST4	O15021	2626 aa		3.45	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4C46	A6NHA9	309 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM250	H0YL14	139 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	COX7A2P2	O60397	106 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNA4	P05014	189 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	FBP1	P09467	338 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMB3	P49720	205 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MP68	P56378	58 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	RTL8B	Q17RB0	113 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF714	Q96N38	554 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	VGLL1	Q99990	258 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	BIN3	Q9NQY0	253 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	PRND	Q9UKY0	176 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087WWC5	75 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616		B4DEV8	164 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LGALS9	O00182	355 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	CRYGD	P07320	174 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL2	P10415	239 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB13	P51153	203 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MPV17L2	Q567V2	206 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TCF23	Q7RTU1	214 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	C16orf74	Q96GX8	76 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	HIVEP1	P15822	2718 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF727	A8MUV8	499 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	INS	P01308	110 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1D-33	P01593	117 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1-33	P01594	117 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	APOA2	P02652	100 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	CCL3L1	P16619	93 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	NPY1R	P25929	384 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	DDT	P30046	118 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	OPRK1	P41145	380 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LYZ	P61626	148 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00311	Q8N616	119 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SFRP2	Q96HF1	295 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35E1	Q96K37	410 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	YPEL4	Q96NS1	127 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A096LNT2	108 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	FNDC10	F2Z333	226 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LY6H	O94772	140 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1-16	P04430	117 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LYNX1	P0DP58	116 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86

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