RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	CST9LP1	Q5W188	147 aa		11.56	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		11.56	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.56	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035		M0R2P5	195 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	PEX7	O00628	323 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TYMS	P04818	313 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMUB2	Q71RG4	321 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASL10A	Q92737	203 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRO0255	Q9UI72	69 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		11.55	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		11.54	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.54	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	FHIT	P49789	147 aa		11.54	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.54	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2G1	P62253	170 aa		11.53	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.53	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		11.53	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		11.53	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.53	□□□□□ -0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.52	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.52	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZR54	194 aa		11.52	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		11.52	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		11.52	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		11.52	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q9H8V8	135 aa		11.52	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A096LPF7	62 aa		11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1B0GV50	99 aa		11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035		C9JCJ5	164 aa		11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	SFTA3	P0C7M3	94 aa		11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRYBA4	P53673	196 aa		11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	FHL2	Q14192	279 aa		11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ESRG	Q1W209	222 aa		11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.51	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.5	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		11.5	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.5	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAGE4	O60829	102 aa		11.5	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.5	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.5	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF479	Q96JC4	524 aa		11.5	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	AKR1C3	P42330	323 aa		11.49	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF876P	Q49A33	203 aa		11.49	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q86TA4	180 aa		11.49	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.48	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ORM1	P02763	201 aa		11.48	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZNX1	250 aa		11.48	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		11.48	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	NACA	E9PAV3	2078 aa		11.48	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	RTL8C	O15255	209 aa		11.47	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRI	P30626	198 aa		11.47	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB5C	P51148	216 aa		11.47	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.47	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		11.47	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	UPK3B	Q9BT76	320 aa		11.47	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	MUC4	Q99102	2169 aa		11.46	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	CIDEA	O60543	219 aa		11.46	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1QB	P02746	253 aa		11.46	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	GYPE	P15421	78 aa		11.46	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASIP	P42127	132 aa		11.46	□□□□□ -0.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		11.45	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035		B4DEV8	164 aa		11.45	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.45	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	AKAP14	Q86UN6	197 aa		11.45	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.45	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.45	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		11.45	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.45	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.44	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.44	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035		K7EQD1	137 aa		11.44	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035		M0R036	132 aa		11.44	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.44	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	KMT2A	Q03164	3969 aa		11.43	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SIVA1	O15304	175 aa		11.43	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SH2D1A	O60880	128 aa		11.43	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	LTA	P01374	205 aa		11.43	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		11.43	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC51B	Q86UW2	128 aa		11.43	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTH2	Q96A98	100 aa		11.43	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.43	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		11.43	□□□□□ -0.58

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