RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 NAGKQ9UJ70 344 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 COL6A5A8TX70 2615 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC21Q5SSG8 566 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 RASL11AQ6T310 242 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 LYZL1Q6UWQ5 148 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 GTSCR1Q86UQ5 136 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GXF2 115 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 CTRLP40313 264 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TDRG1Q3Y452 100 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 COX19Q49B96 90 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM159AQ6UWV7 190 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TPPP3Q9BW30 176 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GUT8 65 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TRGC2P03986 189 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMS2P0C7Q2 107 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 RBMY1CP0DJD4 496 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNS1Q96KK3 526 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 GNB1LQ9BYB4 327 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 AMBPP02760 352 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 DNLZQ5SXM8 178 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB125Q8N687 156 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR31Q5SQ13 230 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR73Q6P4I2 378 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM136Q6ZRR5 245 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf196B1AJZ1 125 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 F2Z2F3 143 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 PHOX2AO14813 284 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 GNRH2O43555 120 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 HBBP68871 147 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 BORCS7Q96B45 105 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 CNFNQ9BYD5 112 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 NOTCH3Q9UM47 2321 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SNURFLB1AK76 121 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SNAI2O43623 268 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 RIGQ13278 110 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 MDFIQ99750 246 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 C20orf144Q9BQM9 153 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5AL1P0C617 328 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ASIPP42127 132 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMPP49913 170 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 Q8N1Y9 231 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 INSP01308 110 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 MT-ND6P03923 174 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 MED14OSP0DP75 135 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 FABP9Q0Z7S8 132 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 OXLD1Q5BKU9 147 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GW15 77 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BVH4 76 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 RIPPLY3P57055 190 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB4BP61018 213 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 XCL2Q9UBD3 114 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC21A0A140T8X8 626 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-DQA1P01909 254 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB5BP61020 215 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 S100A4P26447 101 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GATD1Q8NB37 220 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 FRZBQ92765 325 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SCRT2Q9NQ03 307 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 NTF3P20783 257 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP82Q8N141 532 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 S100A8P05109 93 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10AG1Q8NH19 301 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00467Q9BRT7 94 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SSTP61278 116 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TWIST1Q15672 202 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf158Q8N1D5 194 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TRGV11A0A075B6L2 103 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TRGC1P0CF51 173 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNG7P62955 275 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF493Q6ZR52 646 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM256Q8N2U0 113 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC01587Q99440 93 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 MSRB1Q9NZV6 116 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ANK2Q01484 3957 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CBY3A6NI87 242 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SLAQ13239 276 aa18.13■□□□□ 0.49
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