RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596282.5

ZNF548-205, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF548, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-205ENST00000596282 TMED6Q8WW62 240 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 KCNS1Q96KK3 526 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 TREM1Q9NP99 234 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 F6UZH7 168 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 K7EQM0 130 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 UPK1BO75841 260 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 GCSHP23434 173 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 GNRH2O43555 120 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 MPC2O95563 127 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 DEFA1P59665 94 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 DEFA3P59666 94 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 ZFP69Q49AA0 526 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 Q5VSD8 79 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 ASB13Q8WXK3 278 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 HSPG2P98160 4391 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 TYMSP04818 313 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 H2BFSP57053 126 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 TDRG1Q3Y452 100 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 Q9HAA7 133 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.53□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 FAM229AH3BQW9 127 aa7.53□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 KRTAP10-1P60331 282 aa7.53□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 RAB2AP61019 212 aa7.53□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 GNG5P63218 68 aa7.53□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF876PQ49A33 203 aa7.53□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 SGK494Q96LW2 274 aa7.53□□□□□ -1.2
ZNF548-205ENST00000596282 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 CIDEAO60543 219 aa7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 IGHV3-30P01768 117 aa7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 IGHV3-33P01772 117 aa7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 XGP55808 180 aa7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 RHOHQ15669 191 aa7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.52□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.51□□□□□ -1.21
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ZNF548-205ENST00000596282 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.51□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 TIRAPP58753 221 aa7.51□□□□□ -1.21
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ZNF548-205ENST00000596282 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.51□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.51□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.51□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.51□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.5□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 GCGP01275 180 aa7.5□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.5□□□□□ -1.21
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ZNF548-205ENST00000596282 SMUG1Q53HV7 270 aa7.49□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 LELP1Q5T871 98 aa7.49□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.49□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 Q6ZSN1 163 aa7.49□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 PRNTQ86SH4 94 aa7.49□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.49□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 TVP23CQ96ET8 276 aa7.49□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 TM2D2Q9BX73 214 aa7.49□□□□□ -1.21
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ZNF548-205ENST00000596282 PSG8Q9UQ74 426 aa7.49□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 RS1O15537 224 aa7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 MBP02144 154 aa7.48□□□□□ -1.21
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ZNF548-205ENST00000596282 HAMPP81172 84 aa7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 IFITM3Q01628 133 aa7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 Q8N814 137 aa7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 RAB24Q969Q5 203 aa7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 CXorf1O96002 111 aa7.47□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 IFNA7P01567 189 aa7.47□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 STAG3L2P0CL84 134 aa7.47□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 STAG3L3P0CL85 134 aa7.47□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
ZNF548-205ENST00000596282 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
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