RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 J3QL48 77 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QBP02746 253 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 TYMSP04818 313 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 Q9HAA7 133 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 H0YIZ8 118 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS2R45P59539 299 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 KHDC3LQ587J8 217 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 HYLS1Q96M11 299 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC32Q9BV29 185 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 NMES1Q9C002 83 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 PGPA6NDG6 321 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 F6UZH7 168 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 SIX6O95475 246 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3-30P01768 117 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3-33P01772 117 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 RHOHQ15669 191 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 LELP1Q5T871 98 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZSA8 131 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 TVP23CQ96ET8 276 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNS1Q96KK3 526 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP5SQ99766 215 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 OTORQ9NRC9 128 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 CIDEAO60543 219 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 WFDC2Q14508 124 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 LAGE3Q14657 143 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 ASB13Q8WXK3 278 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 TREM1Q9NP99 234 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 MBD2Q9UBB5 411 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 RS1O15537 224 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF876PQ49A33 203 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 TM2D2Q9BX73 214 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 GNG5P63218 68 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 ASAH1Q13510 395 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 Q8N3U1 123 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 C9orf85Q96MD7 179 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 HSPB11Q9Y547 144 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 H2BFSP57053 126 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 LECT2O14960 151 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 ENKURQ8TC29 256 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 PTH2Q96A98 100 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 SGK494Q96LW2 274 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PPV4 95 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 TAAR5O14804 337 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 MPC2O95563 127 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 GCGP01275 180 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 PET100P0DJ07 73 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00694P0DN24 101 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.2 ms