RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	SPX	Q9BT56	116 aa		14.03	□□□□□ -0.16
PSME3-209	ENST00000589469	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		14.03	□□□□□ -0.16
PSME3-209	ENST00000589469	GCG	P01275	180 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	SMUG1	Q53HV7	270 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	KCNS1	Q96KK3	526 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	LINC00479	Q96M42	142 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469		H3BNG1	76 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		14	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	GNRH2	O43555	120 aa		14	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	TYMS	P04818	313 aa		14	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	CST9LP1	Q5W188	147 aa		14	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		14	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	IGHV3-53	P01767	116 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	C1QB	P02746	253 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	CCL18	P55774	89 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469		Q86TA4	180 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1B0GV50	99 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	AKAP14	Q86UN6	197 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	RASL10A	Q92737	203 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469		M0R2N4	97 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469		M0R2P5	195 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	PAGE4	O60829	102 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	UBE2G1	P62253	170 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	SLA	Q13239	276 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	FMC1	Q96HJ9	113 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-209	ENST00000589469	RAB5C	P51148	216 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	PRO0255	Q9UI72	69 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	PAX4	O43316	350 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	AKR1C3	P42330	323 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	FHL2	Q14192	279 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	SLC51B	Q86UW2	128 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469		A0A096LPF7	62 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	SFTA3	P0C7M3	94 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	CRYBA4	P53673	196 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469		Q6ZR54	194 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF479	Q96JC4	524 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	LTA	P01374	205 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	SULT1A2	P50226	295 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	ESRG	Q1W209	222 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	C9orf85	Q96MD7	179 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PSME3-209	ENST00000589469	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469		C9JCJ5	164 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF876P	Q49A33	203 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	GNG13	Q9P2W3	67 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469		B4DEV8	164 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	SH2D1A	O60880	128 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	ORM1	P02763	201 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	ASIP	P42127	132 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	CRIP1	P50238	77 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	CCL20	P78556	96 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	PTH2	Q96A98	100 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	UPK3B	Q9BT76	320 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469		Q9H8V8	135 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469		M0R036	132 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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