RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R17O96001 155 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 IGLC3P0DOY3 106 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 G0S2P27469 103 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LMO4P61968 165 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 CACNG7P62955 275 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 RHOGP84095 191 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ATP5G2Q06055 141 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 PAX8Q06710 450 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LEMD1Q68G75 181 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 RCHY1Q96PM5 261 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 TNCP24821 2201 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 OR2T8A6NH00 312 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 C2orf70A6NJV1 201 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ZNF785A8K8V0 405 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 F8W735 103 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 J3QLI3 93 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 NDUFA4O00483 81 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 IGHV1-69P01742 117 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 APELAP0DMC3 54 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 IGLL1P15814 213 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 KLRD1Q13241 179 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZN92 141 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 DEFB125Q8N687 156 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 AJUBAQ96IF1 538 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 A6NJY4 79 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 OVOL1O14753 267 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 TCAPO15273 167 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ATP6V0E1O15342 81 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 SH2D1AO60880 128 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 CLEC3BP05452 202 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ZNF138P52744 262 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 NDPQ00604 133 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LCN12Q6JVE5 192 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 Q8N976 141 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 SMPXQ9UHP9 88 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 PKD1P98161 4303 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LINC01546A6NGU7 62 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 OR4C46A6NHA9 309 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 HBDP02042 147 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 IGLC6P0CF74 106 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 TSPOP30536 169 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 GPR183P32249 361 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ECSCRQ19T08 205 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LINC01545Q5VT33 79 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LINC00477Q96M19 166 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 PRELID3AQ96N28 172 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 U3KQE9 123 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 MUC2Q02817 5179 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 CKS2P33552 79 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 FOXE3Q13461 319 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 PIFOQ8TCI5 191 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 MRAP2Q96G30 205 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GV90 55 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 PRSS47A8MTI9 375 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 K7EMT4 169 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 M0R3E3 92 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 SIVA1O15304 175 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 DLEU1O43261 78 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 ATP5LO75964 103 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 IGHG2P01859 326 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 TWIST1Q15672 202 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.13□□□□□ -1.43
GGA3-218ENST00000584243 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.13□□□□□ -1.43
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