RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 COL7A1Q02388 2944 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 CXCL1P09341 107 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 MIFP14174 115 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 RRN3P1Q2M238 152 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 DNLZQ5SXM8 178 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 PRR27Q6MZM9 219 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 ZNF575Q86XF7 245 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 NUDT11Q96G61 164 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 ZMAT4Q9H898 229 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 OSTCQ9NRP0 149 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 P01737 135 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 ORM1P02763 201 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 ADIRFQ15847 76 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 MUC21Q5SSG8 566 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 CBY3A6NI87 242 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 B4DEV8 164 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 TYMSP04818 313 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 AZU1P20160 251 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 ERVFC1-1P60608 527 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 CT83Q5H943 113 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 Q8NAQ8 132 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 C16orf74Q96GX8 76 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 SFRP2Q96HF1 295 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 RETNQ9HD89 108 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 NAGKQ9UJ70 344 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 TMEM189A5PLL7 270 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 GNRH2O43555 120 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 PRM2P04554 102 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 XKRY2A2RUG3 117 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 M0R036 132 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 MED14OSP0DP75 135 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 HTN1P15515 57 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 IL17DQ8TAD2 202 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 V9GYV3 84 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 TGP01266 2768 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 FAM231BA6NCW3 169 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 PPP1R2P9O14990 202 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 ASIPP42127 132 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 TCL1AP56279 114 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 ZNF415Q09FC8 603 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 C9orf85Q96MD7 179 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 SPXQ9BT56 116 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 IL36BQ9NZH7 164 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 MDFICQ9P1T7 246 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 MUC4Q99102 2169 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 A8MWL6 223 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 MT-ND4LP03901 98 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 IGLC6P0CF74 106 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 RNF212Q495C1 297 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 SVBPQ8N300 66 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 PTH2Q96A98 100 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PPQ1 181 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 LYRM9A8MSI8 78 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 SNURFLB1AK76 121 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 SNAI2O43623 268 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 APOC3P02656 99 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 OR5AL1P0C617 328 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 RHEBQ15382 184 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-211ENST00000582232 TSKUQ8WUA8 353 aa8.24□□□□□ -1.09
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