RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLA2G10O15496 165 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10J4P0C629 311 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 INPP1P49441 399 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 C14orf177Q52M58 125 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 KLK12Q9UKR0 248 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 C5orf51A6NDU8 294 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 TSC22D2O75157 780 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 TYMSP04818 313 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRTAP10-8P60410 259 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 RAB31Q13636 194 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 NIT1Q86X76 327 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 UBE2WQ96B02 151 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 C2orf50Q96LR7 162 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 CIDEAO60543 219 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 NDUFB6O95139 128 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC00694P0DN24 101 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR51M1Q9H341 326 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q9UF83 564 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A0J9YXV3 536 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAGE12JA6NER3 117 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 LYRM1O43325 122 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRSS1P07477 247 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 CAV2P51636 162 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 TAS2R30P59541 319 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAGE1Q13065 139 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAGE4Q13068 117 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAGE5Q13069 117 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF876PQ49A33 203 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAGE13Q4V321 117 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.62□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A087WWC5 75 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 C7orf66A4D0T2 115 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBAKDNA6NC62 111 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 USP17L23D6RBM5 183 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCGB1D2O95969 90 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 SEC11BP0C7V7 166 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 IFITM3Q01628 133 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 S100ZQ8WXG8 99 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC32Q9BV29 185 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 C9orf170A2RU37 121 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 CENPXA8MT69 81 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 DIRC3C9JPN6 131 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 PHOX2AO14813 284 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 TCRBP04435 133 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q0VG73 95 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 WDR73Q6P4I2 378 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 FXYD5Q96DB9 178 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATP5SQ99766 215 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A087WYN8 130 aa6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 UPK1BO75841 260 aa6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 CST7O76096 145 aa6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 CSN1S1P47710 185 aa6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 RANP62826 216 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 ELOBQ15370 118 aa6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 ENHOQ6UWT2 76 aa6.58□□□□□ -1.36
CTDNEP1-202ENST00000570380 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.58□□□□□ -1.36
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