RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 GCGP01275 180 aa14.71□□□□□ -0.05
SNAP23-216ENST00000568331 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.71□□□□□ -0.05
SNAP23-216ENST00000568331 PEX7O00628 323 aa14.7□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 GNRH2O43555 120 aa14.7□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 IGLV2-11P01706 119 aa14.7□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 IGHV3-53P01767 116 aa14.7□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 FHITP49789 147 aa14.7□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.7□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.69□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 CST9LP1Q5W188 147 aa14.69□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.69□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 LINC00479Q96M42 142 aa14.69□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.69□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.68□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 TYMSP04818 313 aa14.68□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 SLAQ13239 276 aa14.68□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.68□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 MUC4Q99102 2169 aa14.68□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 Q6ZNX1 250 aa14.67□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.67□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.66□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 M0R2P5 195 aa14.66□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 PAX4O43316 350 aa14.66□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.66□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 RASL10AQ92737 203 aa14.66□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.66□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.66□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 PRO0255Q9UI72 69 aa14.66□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.66□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.66□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 A0A1B0GV50 99 aa14.65□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.65□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 UBE2G1P62253 170 aa14.65□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.65□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.65□□□□□ -0.06
SNAP23-216ENST00000568331 PAGE4O60829 102 aa14.64□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.64□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 Q86TA4 180 aa14.64□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 FMC1Q96HJ9 113 aa14.64□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.64□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.63□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 FHL2Q14192 279 aa14.63□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.63□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.63□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.63□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.63□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.63□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 A0A096LPF7 62 aa14.62□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.62□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 C1QBP02746 253 aa14.62□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 SFTA3P0C7M3 94 aa14.62□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 CRYBA4P53673 196 aa14.62□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 Q6ZR54 194 aa14.62□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF479Q96JC4 524 aa14.62□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 AKR1C3P42330 323 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 ESRGQ1W209 222 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 AKAP14Q86UN6 197 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 C9JCJ5 164 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 RAB5CP51148 216 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 TEX46H3BTG2 121 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 S100A4P26447 101 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF876PQ49A33 203 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 Q9H8V8 135 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP23-216ENST00000568331 BIRC6Q9NR09 4857 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 ORM1P02763 201 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 B4DEV8 164 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 RTL8CO15255 209 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 SLC51BQ86UW2 128 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 C9orf85Q96MD7 179 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 UPK3BQ9BT76 320 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 ASIPP42127 132 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 MANBALQ9NQG1 85 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 DNAH2Q9P225 4427 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.55□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 LTAP01374 205 aa14.55□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 SULT1A2P50226 295 aa14.55□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.55□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 GNG13Q9P2W3 67 aa14.55□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.54□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 CIDEAO60543 219 aa14.54□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 SH2D1AO60880 128 aa14.54□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 GYPEP15421 78 aa14.54□□□□□ -0.08
SNAP23-216ENST00000568331 SRIP30626 198 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms