RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE1Q13065 139 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE4Q13068 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE5Q13069 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE13Q4V321 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZRG5 221 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.11□□□□□ -1.43
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SMAD3-211ENST00000559460 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.1□□□□□ -1.43
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SMAD3-211ENST00000559460 PSENENQ9NZ42 101 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 H7C1H1 209 aa6.09□□□□□ -1.43
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SMAD3-211ENST00000559460 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.09□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 PFDN5Q99471 154 aa6.09□□□□□ -1.43
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SMAD3-211ENST00000559460 CHTF8P0CG12 524 aa6.08□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.08□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.08□□□□□ -1.44
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SMAD3-211ENST00000559460 CCDC32Q9BV29 185 aa6.08□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.08□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.08□□□□□ -1.44
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SMAD3-211ENST00000559460 TMEM262E9PQX1 116 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 GNRH2O43555 120 aa6.07□□□□□ -1.44
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SMAD3-211ENST00000559460 AKAIN1P0CW23 69 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 CSN1S1P47710 185 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 PYDC2Q56P42 97 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 Q6AWC8 147 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00479Q96M42 142 aa6.07□□□□□ -1.44
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SMAD3-211ENST00000559460 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 KCNS1Q96KK3 526 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 SSSCA1O60232 199 aa6.05□□□□□ -1.44
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SMAD3-211ENST00000559460 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.05□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.05□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.05□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 CCSO14618 274 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 TYMSP04818 313 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 CAV2P51636 162 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 MIAQ16674 131 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 MAJINQ3KP22 176 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 ASB13Q8WXK3 278 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 MCUBQ9NWR8 336 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 V9GYH0 126 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 RBAKDNA6NC62 111 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 UPK1BO75841 260 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 TCRBP04435 133 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 PYYP10082 97 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 DEFA1P59665 94 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 DEFA3P59666 94 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 AP3S2P59780 193 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 ENHOQ6UWT2 76 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZRP5 223 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.03□□□□□ -1.44
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