RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GCHFRP30047 84 aa5.13□□□□□ -1.59
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.13□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUP37Q8NFH4 326 aa5.13□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DPM3Q9P2X0 92 aa5.13□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CASC10Q5T4H9 136 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GNG13Q9P2W3 67 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WDR90Q96KV7 1748 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DOCK7Q96N67 2140 aa5.05□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SSC5DA1L4H1 1573 aa5.05□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANKRD12Q6UB98 2062 aa5.05□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.05□□□□□ -1.6
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