RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 KIR2DS2P43631 304 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf56Q8N813 242 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 ACANP16112 2415 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 M0R1W7 72 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 SCGB2A1O75556 95 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 LEPP41159 167 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 CKS2P33552 79 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 WT1-ASQ06250 92 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 EVI2AP22794 236 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 LMO4P61968 165 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 TEN1Q86WV5 123 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 DPM3Q9P2X0 92 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 CTSZQ9UBR2 303 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01549A6NIU2 74 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 RHODO00212 210 aa7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 F8P00451 2351 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 H3BVH4 76 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 DPM2O94777 84 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF688P0C7X2 276 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 C17orf77Q96MU5 243 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 IL4P05112 153 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 ARL3P36405 182 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 C8orf49Q96NF6 230 aa7.84□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 CGB1A6NKQ9 187 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 POU2AF1Q16633 256 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZQT7 251 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 TACC2O95359 2948 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 APELAP0DMC3 54 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFA3O95167 84 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 LY6EQ16553 131 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 FBXL15Q9H469 300 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 JMJD1CQ15652 2540 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 GAGE2BQ13066 116 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 TAL2Q16559 108 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 GAGE2EQ4V326 116 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.83□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.82□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 RAX2Q96IS3 184 aa7.82□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 M0QXV9 152 aa7.82□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 NPFFO15130 113 aa7.82□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 TCL1BO95988 128 aa7.82□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 HLA-DRB4P13762 266 aa7.82□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.82□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 THAP8Q8NA92 274 aa7.82□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.82□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 LY6G6DO95868 133 aa7.81□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 TWIST1Q15672 202 aa7.81□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 HCP5Q6MZN7 132 aa7.81□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.81□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 M0R3E3 92 aa7.81□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV1-69P01742 117 aa7.81□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.81□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 MTORP42345 2549 aa7.8□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.8□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 IFITM1P13164 125 aa7.8□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 TTC32Q5I0X7 151 aa7.8□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.8□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 OTORQ9NRC9 128 aa7.8□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2E1P51965 193 aa7.8□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.8□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2D3P61077 147 aa7.79□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2D2P62837 147 aa7.79□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.79□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.79□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.79□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 SNCGO76070 127 aa7.79□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 CGB3P0DN86 165 aa7.79□□□□□ -1.16
TRPS1-211ENST00000520276 CGB7P0DN87 165 aa7.79□□□□□ -1.16
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