RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 FAM231DQ6ZW35 169 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 A0A087WWC5 75 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1W2PPQ1 181 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 A8MTW9 85 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00587B1AMM8 73 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 CXCL1P09341 107 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 LEPP41159 167 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 NEU1Q99519 415 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-206ENST00000517323 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 MUC4Q99102 2169 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM189A5PLL7 270 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 ELOBQ15370 118 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 Q6AWC8 147 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 ZFP82Q8N141 532 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 COLCA2A8K830 154 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 HIGD1CA8MV81 97 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 FAM110AQ9BQ89 295 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 SMCO4Q9NRQ5 59 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 COL7A1Q02388 2944 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 C5orf52A6NGY3 159 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 UBE2CO00762 179 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 IL36BQ9NZH7 164 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 YPEL4Q96NS1 127 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 ODF3Q96PU9 254 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 TSPOP30536 169 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 NUP35Q8NFH5 326 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 H3BVH4 76 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 LINC01559Q495D7 138 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 TSKUQ8WUA8 353 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 TUBA4BQ9H853 241 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 MDFICQ9P1T7 246 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 PPP1R2P9O14990 202 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 TYMSP04818 313 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 S100A6P06703 90 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 AZU1P20160 251 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 S100PP25815 95 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 LINC01587Q99440 93 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 NIT2Q9NQR4 276 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 A8MWL6 223 aa11.27□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 INSP01308 110 aa11.27□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 ARMS2P0C7Q2 107 aa11.27□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.27□□□□□ -0.6
TRPS1-206ENST00000517323 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 DEFB135Q30KP9 77 aa11.27□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.27□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 OR10AG1Q8NH19 301 aa11.27□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 CSTL1Q9H114 145 aa11.27□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 CBY3A6NI87 242 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 CAMPP49913 170 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 CXorf65A6NEN9 183 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 IGLC6P0CF74 106 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 CT83Q5H943 113 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 RETNQ9HD89 108 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 K7EIL1 84 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 FAM210BQ96KR6 192 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 M0R381 172 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 DEFB4AO15263 64 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 IMMP2LQ96T52 175 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 NTF3P20783 257 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 ASIPP42127 132 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 JPT2Q9H910 190 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 EMP1P54849 157 aa11.21□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 RAB4BP61018 213 aa11.21□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 TDRG1Q3Y452 100 aa11.21□□□□□ -0.61
TRPS1-206ENST00000517323 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms