RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517164.1

RNU6-1028P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1028, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1028P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PBRM1Q86U86 1689 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CCDC115Q96NT0 180 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 V9GYQ6 96 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CPDO75976 1380 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IGF2RP11717 2491 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CACNA1HO95180 2353 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SPAG17Q6Q759 2223 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IFNA21P01568 189 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KLKP1Q107X0 134 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM128Q5BJH2 165 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SAMD13Q5VXD3 122 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ATG5Q9H1Y0 275 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CENPHQ9H3R5 247 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RREB1Q92766 1687 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TANC1Q9C0D5 1861 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 UQCRQO14949 82 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CCKP06307 115 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TOMM20LQ6UXN7 152 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM14BQ9NUH8 114 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DLEC1Q9Y238 1755 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TTC28Q96AY4 2481 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 A0A096LNT2 108 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR4S1Q8NGB4 309 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 HELZP42694 1942 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TCRAP04437 139 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ADCYAP1P18509 176 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PCBD1P61457 104 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM35BQ8NCS4 154 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KDM6BO15054 1643 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LRP5O75197 1615 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 WDR97A6NE52 1622 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MPC1LP0DKB6 136 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PTPRGP23470 1445 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 S100A5P33763 92 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PROK2Q9HC23 129 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MED23Q9ULK4 1368 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ABCA12Q86UK0 2595 aa-0□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PIEZO1Q92508 2521 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ABCA4P78363 2273 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 S100GP29377 79 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 Q5XG85 94 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 VMO1Q7Z5L0 202 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MED13LQ71F56 2210 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PSPHP78330 225 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DDA1Q9BW61 102 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TRAV17A0A0B4J275 112 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TFF1P04155 84 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SDC4P31431 198 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DSCR8Q96T75 97 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 J3KT08 172 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR2H2O95918 312 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MYO7AQ13402 2215 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C9JAW5 83 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DPM2O94777 84 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MT-ND4LP03901 98 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NEFHP12036 1026 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PLGLB1Q02325 96 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLC25A26Q70HW3 274 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM141Q96I45 108 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PAEPP09466 180 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PYYP10082 97 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM91Q6ZNR0 172 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CALML5Q9NZT1 146 aa-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms