RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 J3KRW8 73 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-221ENST00000511747 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-221ENST00000511747 SAP30O75446 220 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa20.61■□□□□ 0.89
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SH3BP2-221ENST00000511747 C9orf139Q6ZV77 190 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM223AQ8IWN6 122 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP6V0BQ99437 205 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-221ENST00000511747 LENEPQ9Y5L5 61 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-221ENST00000511747 SPCS1Q9Y6A9 102 aa20.61■□□□□ 0.89
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SH3BP2-221ENST00000511747 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa20.56■□□□□ 0.88
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SH3BP2-221ENST00000511747 FAM19A4Q96LR4 140 aa20.46■□□□□ 0.87
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SH3BP2-221ENST00000511747 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-221ENST00000511747 MGPP08493 103 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-221ENST00000511747 RIPPLY3P57055 190 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST1H4GQ99525 98 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHG2P01859 326 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF223E7ERA6 249 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-221ENST00000511747 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-221ENST00000511747 C2orf66Q6UXQ4 117 aa20.42■□□□□ 0.86
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