RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A096LNT2 108 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 HBDP02042 147 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF747Q9BV97 191 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ZANQ9Y493 2812 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 TCTAP57738 103 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 MGPP08493 103 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 CFHR3Q02985 330 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 KIR3DS1Q14943 382 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6YL49 198 aa8.36□□□□□ -1.07
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RABGEF1-208ENST00000510829 K7EMT4 169 aa8.36□□□□□ -1.07
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RABGEF1-208ENST00000510829 G0S2P27469 103 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 DPF1Q92782 380 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 U3KQK5 164 aa8.36□□□□□ -1.07
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RABGEF1-208ENST00000510829 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 TCAPO15273 167 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 RNF185Q96GF1 192 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 GNRH2O43555 120 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 PRSS1P07477 247 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ELANEP08246 267 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087WW49 117 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 SOCS3O14543 225 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 TSPOP30536 169 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 CNFNQ9BYD5 112 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB136Q30KP8 78 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF575Q86XF7 245 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 ST20Q9HBF5 79 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM89A2RUT3 159 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM17P0DL12 118 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF702PQ9H963 129 aa8.33□□□□□ -1.08
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RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 F5H697 171 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01545Q5VT33 79 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.32□□□□□ -1.08
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RABGEF1-208ENST00000510829 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF580Q9UK33 172 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.31□□□□□ -1.08
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RABGEF1-208ENST00000510829 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 ACANP16112 2415 aa8.3□□□□□ -1.08
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RABGEF1-208ENST00000510829 OR11H1Q8NG94 326 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 FSHBP01225 129 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.29□□□□□ -1.08
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