RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 PEX7O00628 323 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 GCGP01275 180 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 M0R2N4 97 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FHITP49789 147 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 C8orf49Q96NF6 230 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 KMT2AQ03164 3969 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 GNRH2O43555 120 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 IGLV2-11P01706 119 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 Q6ZNX1 250 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 IGHV3-53P01767 116 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE2G1P62253 170 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00479Q96M42 142 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 M0R2P5 195 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PAX4O43316 350 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TYMSP04818 313 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RASL10AQ92737 203 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PRO0255Q9UI72 69 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TEX46H3BTG2 121 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FMC1Q96HJ9 113 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1B0GV50 99 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 PAGE4O60829 102 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB5CP51148 216 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 AKAP14Q86UN6 197 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 C1QBP02746 253 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 AKR1C3P42330 323 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 S100A4P26447 101 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 Q86TA4 180 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 C9JCJ5 164 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 ORM1P02763 201 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 CRYBA4P53673 196 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 FHL2Q14192 279 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF876PQ49A33 203 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC51BQ86UW2 128 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 MUC4Q99102 2169 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A096LPF7 62 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 SFTA3P0C7M3 94 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF479Q96JC4 524 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ESRGQ1W209 222 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 Q9H8V8 135 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CIDEAO60543 219 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 Q6ZR54 194 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 MANBALQ9NQG1 85 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 B4DEV8 164 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ASIPP42127 132 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 GNG13Q9P2W3 67 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 NACAE9PAV3 2078 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 LTAP01374 205 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SRIP30626 198 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SULT1A2P50226 295 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 PTH2Q96A98 100 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC32Q5I0X7 151 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 C9orf85Q96MD7 179 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 UPK3BQ9BT76 320 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SH2D1AO60880 128 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 IFNA1P01562 189 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 GYPEP15421 78 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 M0R036 132 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms