RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 LINC01560Q8TB33 94 aa7.16□□□□□ -1.26
HULC-201ENST00000503668 USMG5Q96IX5 58 aa7.16□□□□□ -1.26
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HULC-201ENST00000503668 HIST1H4GQ99525 98 aa7.16□□□□□ -1.26
HULC-201ENST00000503668 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.16□□□□□ -1.26
HULC-201ENST00000503668 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.15□□□□□ -1.26
HULC-201ENST00000503668 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.15□□□□□ -1.26
HULC-201ENST00000503668 A0A087WW49 117 aa7.15□□□□□ -1.26
HULC-201ENST00000503668 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.15□□□□□ -1.26
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HULC-201ENST00000503668 ASIPP42127 132 aa7.15□□□□□ -1.26
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HULC-201ENST00000503668 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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HULC-201ENST00000503668 GAGE13Q4V321 117 aa7.15□□□□□ -1.26
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HULC-201ENST00000503668 USP34Q70CQ2 3546 aa7.15□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 CEP250Q9BV73 2442 aa7.15□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 EYSQ5T1H1 3165 aa7.14□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 PRAC2D3DTV9 90 aa7.14□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 NXPH4O95158 308 aa7.14□□□□□ -1.27
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HULC-201ENST00000503668 C16orf92Q96LL3 132 aa7.14□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.14□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 S4R3C0 116 aa7.14□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 SPEGQ15772 3267 aa7.14□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.13□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 CCL21O00585 134 aa7.13□□□□□ -1.27
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HULC-201ENST00000503668 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.13□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 CCDC140Q96MF4 163 aa7.13□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.13□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.13□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 ZNF580Q9UK33 172 aa7.13□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.13□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.13□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.12□□□□□ -1.27
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HULC-201ENST00000503668 SCGB2A2Q13296 93 aa7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 ECSCRQ19T08 205 aa7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 ODF3Q96PU9 254 aa7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 TIMM17AQ99595 171 aa7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 ACACAQ13085 2346 aa7.12□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 FRYLO94915 3013 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 FRYQ5TBA9 3013 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 VCYO14598 125 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 NPFFO15130 113 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 IGHV3-23P01764 117 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 TRGV3P03979 118 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 IGF1P05019 195 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 RIPPLY3P57055 190 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.11□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 H3BVH4 76 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 K7EMT4 169 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 ID1P41134 155 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 UBE2D1P51668 147 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 RNF182Q8N6D2 247 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 RASL10AQ92737 203 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 AJUBAQ96IF1 538 aa7.1□□□□□ -1.27
HULC-201ENST00000503668 PRO0461Q9UI25 63 aa7.1□□□□□ -1.27
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