RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.51□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q86TA4 180 aa13.51□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.5□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.5□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.5□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 PAGE4O60829 102 aa13.5□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUDT3O95989 172 aa13.5□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.5□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.5□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCEAL7Q9BRU2 100 aa13.5□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.49□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 GCGP01275 180 aa13.49□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 SULT1A2P50226 295 aa13.49□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 TDRG1Q3Y452 100 aa13.49□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 RNF212Q495C1 297 aa13.49□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPINK4O60575 86 aa13.48□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMUG1Q53HV7 270 aa13.48□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.48□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.48□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 MDFICQ9P1T7 246 aa13.48□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRGV2A0A075B6R0 118 aa13.47□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 PFN1P07737 140 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa13.46□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 AKR1C3P42330 323 aa13.46□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR5I1Q13606 314 aa13.46□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13.46□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 FMC1Q96HJ9 113 aa13.46□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.46□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 MUC4Q99102 2169 aa13.45□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 TYMSP04818 313 aa13.45□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBE2G1P62253 170 aa13.45□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCL20P78556 96 aa13.45□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 KCNS1Q96KK3 526 aa13.45□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 C18orf15Q96N68 181 aa13.45□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 MANBALQ9NQG1 85 aa13.45□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 GNG13Q9P2W3 67 aa13.45□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.45□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.44□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCO2A0A1W2PP80 73 aa13.44□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 GNRH2O43555 120 aa13.44□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 HOXA5P20719 270 aa13.44□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCL18P55774 89 aa13.44□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 TEX46H3BTG2 121 aa13.43□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 SOHLH1Q5JUK2 328 aa13.43□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPXQ9BT56 116 aa13.43□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.42□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa13.42□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 LTAP01374 205 aa13.42□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.42□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZFP30Q9Y2G7 519 aa13.42□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A0J9YY99 117 aa13.41□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRSS29PA6NIE9 313 aa13.41□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 ALKAL2Q6UX46 152 aa13.41□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV3-53P01767 116 aa13.4□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.4□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.4□□□□□ -0.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 M0R2P5 195 aa13.39□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZR54 194 aa13.39□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 NHLRC2Q8NBF2 726 aa13.39□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 RASL10AQ92737 203 aa13.39□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.38□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 RTL8CO15255 209 aa13.38□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 SH2D1AO60880 128 aa13.38□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 IFNA1P01562 189 aa13.38□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 S100A9P06702 114 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.38□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 C1orf134Q5TEV5 83 aa13.38□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.37□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 BCL2P10415 239 aa13.37□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 CRIP1P50238 77 aa13.37□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 C11orf52Q96A22 123 aa13.37□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNAH2Q9P225 4427 aa13.37□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 C9orf85Q96MD7 179 aa13.36□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.36□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00588Q9Y4M8 146 aa13.36□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 B4DEV8 164 aa13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 H3BNG1 76 aa13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 ORM1P02763 201 aa13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 SFTA3P0C7M3 94 aa13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF479Q96JC4 524 aa13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 DERL1Q9BUN8 251 aa13.35□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.34□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 M0R036 132 aa13.34□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 ASIPP42127 132 aa13.34□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 FHL2Q14192 279 aa13.34□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 BAGE2Q86Y30 109 aa13.34□□□□□ -0.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa13.33□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRBOX1C9JBD0 128 aa13.33□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 C9JCJ5 164 aa13.33□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms