RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 HYLS1Q96M11 299 aa8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 NMES1Q9C002 83 aa8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 NAGKQ9UJ70 344 aa8.14□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 M0R2P5 195 aa8.13□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 SIX6O95475 246 aa8.13□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 KHDC3LQ587J8 217 aa8.13□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.13□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.13□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.13□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 TMED6Q8WW62 240 aa8.13□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.13□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.12□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 PGPA6NDG6 321 aa8.12□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 GNRH2O43555 120 aa8.12□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 TDRG1Q3Y452 100 aa8.12□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 ATP5SQ99766 215 aa8.12□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 OTORQ9NRC9 128 aa8.12□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 HERC1Q15751 4861 aa8.12□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 H0YIZ8 118 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 PPT1P50897 306 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 TIRAPP58753 221 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 ASAH1Q13510 395 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 ENKURQ8TC29 256 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 KCNS1Q96KK3 526 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 MBD2Q9UBB5 411 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.11□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.1□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.1□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.1□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 S100ZQ8WXG8 99 aa8.1□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.1□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.1□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 TREM1Q9NP99 234 aa8.1□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1W2PPV4 95 aa8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 CIDEAO60543 219 aa8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 PET100P0DJ07 73 aa8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 ASB13Q8WXK3 278 aa8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 FAT1Q14517 4588 aa8.09□□□□□ -1.11
CNOT4-211ENST00000498534 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.08□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF876PQ49A33 203 aa8.08□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.08□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.08□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.08□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.08□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.08□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 HSPB11Q9Y547 144 aa8.08□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.07□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.07□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 TYMSP04818 313 aa8.07□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZSN1 163 aa8.07□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.07□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.07□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 Q9HAA7 133 aa8.07□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 F6UZH7 168 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 TAAR5O14804 337 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 SSNA1O43805 119 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 MPC2O95563 127 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 H2BFSP57053 126 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 RHOHQ15669 191 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 Q8N814 137 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 TVP23CQ96ET8 276 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 TM2D2Q9BX73 214 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.06□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 K7EQM0 130 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 RS1O15537 224 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 UPK1BO75841 260 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV3-30P01768 117 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV3-33P01772 117 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 LELP1Q5T871 98 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.05□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.04□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 C1QBP02746 253 aa8.04□□□□□ -1.12
CNOT4-211ENST00000498534 HAMPP81172 84 aa8.04□□□□□ -1.12
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