RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC160A6NGH7 325 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 LOC730098B7Z3J9 87 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 TRGC2P03986 189 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 CRHP06850 196 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf33Q6P1S2 294 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 TEX261Q6UWH6 196 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf82Q6UX34 121 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N814 137 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 PPTC7Q8NI37 304 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 U3KQ87 197 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 MYH2Q9UKX2 1941 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINB1P30740 379 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf22Q6V702 233 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 F8P00451 2351 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 NUP98P52948 1817 aa2.4□□□□□ -2.02
PTPRC-212ENST00000491302 ASXL3Q9C0F0 2248 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 TLCD2A6NGC4 264 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 PPP5D1E7EU14 171 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf112F2Z3M2 114 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 M0R2N4 97 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 ROMO1P60602 79 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 TP53RKQ96S44 253 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 COL6A6A6NMZ7 2263 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 LRRK2Q5S007 2527 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 MYOM3Q5VTT5 1437 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 MED13LQ71F56 2210 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 ATRQ13535 2644 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CEP295Q9C0D2 2601 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 OR10J4P0C629 311 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CRYBA4P53673 196 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 STX12Q86Y82 276 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 OR5D14Q8NGL3 314 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 ODF3Q96PU9 254 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 RFX7Q2KHR2 1363 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 RTL9Q8NET4 1388 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 RYR3Q15413 4870 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 PIAS1O75925 651 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 IDO1P14902 403 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 INSL3P51460 131 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC168Q8NDH2 2452 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 ARAP2Q8WZ64 1704 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF714Q96N38 554 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 RTL8AQ9BWD3 113 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 V9GYQ6 96 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 LOC285556D6RIA3 1793 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP13Q12802 2813 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 NUP210LQ5VU65 1888 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV5A0A0B4J249 113 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 INE1O15225 51 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 IFNA4P05014 189 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 VBP1P61758 197 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 MPV17LQ2QL34 196 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 FAM74A1Q5RGS3 127 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CROCCP2Q86T23 111 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 OR5D16Q8NGK9 328 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 SIP14410 1827 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CSN2P05814 226 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 PATE2Q6UY27 113 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 FAM19A2Q8N3H0 131 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 JMJD1CQ15652 2540 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 STAB1Q9NY15 2570 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CSMD1Q96PZ7 3565 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 DAPK1P53355 1430 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 VPS8Q8N3P4 1428 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 NOTCH1P46531 2555 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 PDZD2O15018 2839 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 MYH3P11055 1940 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 E7EUB6 86 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 TMBIM6P55061 237 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf140Q5VVS0 124 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 FAM24BQ8N5W8 94 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 OR4K15Q8NH41 348 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 PATE1Q8WXA2 126 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP30Q9Y2G7 519 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GUL6 1792 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 PLXNB2O15031 1838 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 COL6A5A8TX70 2615 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV10A0A0B4J240 114 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-212ENST00000491302 CCL16O15467 120 aa2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms