RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 OR8J3Q8NGG0 315 aa-0.18□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 DMAC1Q96GE9 116 aa-0.18□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 KLKP1Q107X0 134 aa-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 RHOHQ15669 191 aa-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 PCBD2Q9H0N5 130 aa-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 CBLN4Q9NTU7 201 aa-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-0.19□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA4P78363 2273 aa-0.2□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 A0A0G2JMM0 328 aa-0.2□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 ETV6P41212 452 aa-0.2□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 NAT14Q8WUY8 206 aa-0.2□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 ATPIF1Q9UII2 106 aa-0.2□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.2□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 MED13LQ71F56 2210 aa-0.2□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 LRP5O75197 1615 aa-0.2□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 PTPRGP23470 1445 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 E7EQ34 232 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 FAM107AO95990 144 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 HBDP02042 147 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 IL7P13232 177 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 Q5XG85 94 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 VMO1Q7Z5L0 202 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM7Q9BQ49 75 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 HELZP42694 1942 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 A2MP01023 1474 aa-0.22□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 NEBP20929 6669 aa-0.22□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 M0QZK8 103 aa-0.22□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 PFDN1O60925 122 aa-0.22□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 SMPXQ9UHP9 88 aa-0.22□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 F8P00451 2351 aa-0.22□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.22□□□□□ -2.44
ITGA4-211ENST00000490435 MYO7AQ13402 2215 aa-0.22□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 CACNA1CQ13936 2221 aa-0.23□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 MPC1LP0DKB6 136 aa-0.23□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 IDO2Q6ZQW0 420 aa-0.23□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.23□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 OTOSQ8NHW6 89 aa-0.23□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 ATG5Q9H1Y0 275 aa-0.23□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 PLXNA2O75051 1894 aa-0.23□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.24□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 CCKP06307 115 aa-0.24□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 IQCJQ1A5X6 159 aa-0.24□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 Q5BKY6 102 aa-0.24□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 BRK1Q8WUW1 75 aa-0.24□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 PBRM1Q86U86 1689 aa-0.24□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 HERC1Q15751 4861 aa-0.25□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 ADCYAP1P18509 176 aa-0.25□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 CKS2P33552 79 aa-0.25□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.25□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 OR4S1Q8NGB4 309 aa-0.25□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 UNC79Q9P2D8 2635 aa-0.25□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 TNXBP22105 4242 aa-0.25□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 F5P12259 2224 aa-0.26□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-0.26□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 UQCRQO14949 82 aa-0.26□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 MUC2Q02817 5179 aa-0.26□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 RYR3Q15413 4870 aa-0.26□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 MED23Q9ULK4 1368 aa-0.27□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-0.27□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 SPINK1P00995 79 aa-0.27□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-0.27□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-0.27□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC115Q96NT0 180 aa-0.27□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 RYR1P21817 5038 aa-0.27□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 DSCR8Q96T75 97 aa-0.28□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 USH2AO75445 5202 aa-0.28□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 LRP2P98164 4655 aa-0.28□□□□□ -2.45
ITGA4-211ENST00000490435 HERC2O95714 4834 aa-0.29□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa-0.29□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 TCRAP04437 139 aa-0.29□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM128Q5BJH2 165 aa-0.29□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-0.29□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.29□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.29□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1B0GV72 72 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 OR2H2O95918 312 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 FABP1P07148 127 aa-0.3□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms