RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 OGNP20774 298 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 IZUMO2Q6UXV1 221 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 RTL9Q8NET4 1388 aa-0.82□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 PKD1P98161 4303 aa-0.82□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 AKAP13Q12802 2813 aa-0.82□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 C9JAW5 83 aa-0.82□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 FABP4P15090 132 aa-0.82□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 GCHFRP30047 84 aa-0.82□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa-0.82□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-0.82□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa-0.82□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 C2CD3Q4AC94 2353 aa-0.82□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 OR2H1Q9GZK4 316 aa-0.83□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 ARMC1Q9NVT9 282 aa-0.83□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 TMEM242Q9NWH2 141 aa-0.83□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 G3V2T6 193 aa-0.84□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa-0.84□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 LAMB1P07942 1786 aa-0.85□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.86□□□□□ -2.55
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SENP6-210ENST00000487548 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 H0YGG7 62 aa-0.86□□□□□ -2.55
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SENP6-210ENST00000487548 IGKCP01834 107 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 APOA2P02652 100 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 COX4I1P13073 169 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 COX6B1P14854 86 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 SPRR1BP22528 89 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 NDUFA6P56556 154 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 LYPD5Q6UWN5 251 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 Q6ZRX8 168 aa-0.86□□□□□ -2.55
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