RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.75□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 SRIP30626 198 aa7.75□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.75□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.75□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.75□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GUS0 222 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 OR4C46A6NHA9 309 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 KLLNB2CW77 178 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 F2Z2F3 143 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 J3KRW8 73 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 CD33P20138 364 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF575Q86XF7 245 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 BAGE3Q86Y29 109 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 CNFNQ9BYD5 112 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 NAGKQ9UJ70 344 aa7.74□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM6P0DI80 62 aa7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 FABP4P15090 132 aa7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPOP30536 169 aa7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.73□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 C7orf71A4D174 169 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 SERF1AO75920 110 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 AMBPP02760 352 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 OR5AL1P0C617 328 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 ESDP10768 282 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB131AP59861 70 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 TWIST1Q15672 202 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR31Q5SQ13 230 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZQT7 251 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM18Q96B42 140 aa7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 KNCNA6PVL3 124 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 SNAI2O43623 268 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV3-20P01619 116 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 MED14OSP0DP75 135 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 HLA-DRB4P13762 266 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 ASIPP42127 132 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00310P59036 64 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP10-3P60369 221 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 CACNG7P62955 275 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 KIR3DS1Q14943 382 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 MUC21Q5SSG8 566 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.71□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 A8MTW9 85 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 H3BVH4 76 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 NUPR1O60356 82 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 NTF3P20783 257 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 CDKN1BP46527 198 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 SSTP61278 116 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 IQCJQ1A5X6 159 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 DNLZQ5SXM8 178 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 AMTNQ6UX39 209 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNS1Q96KK3 526 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 H3BMM0 161 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 SAP30O75446 220 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 RCHY1Q96PM5 261 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 C12orf57Q99622 126 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF747Q9BV97 191 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 U3KQK5 164 aa7.69□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 M0R2Z0 102 aa7.68□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 PF4P02776 101 aa7.68□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.68□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.68□□□□□ -1.18
GTPBP1-211ENST00000487538 AMN1Q8IY45 258 aa7.68□□□□□ -1.18
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