RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486695.1

KIFC1-213, Transcript of kinesin family member C1, human

TSL 3

Gene KIFC1, Length 667 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC1-213	ENST00000486695	MT-ND6	P03923	174 aa		6.72	□□□□□ -1.33
KIFC1-213	ENST00000486695	CDKN1B	P46527	198 aa		6.72	□□□□□ -1.33
KIFC1-213	ENST00000486695	RAB4B	P61018	213 aa		6.72	□□□□□ -1.33
KIFC1-213	ENST00000486695	FRZB	Q92765	325 aa		6.72	□□□□□ -1.33
KIFC1-213	ENST00000486695	TPPP3	Q9BW30	176 aa		6.72	□□□□□ -1.33
KIFC1-213	ENST00000486695	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		6.72	□□□□□ -1.33
KIFC1-213	ENST00000486695	NAGK	Q9UJ70	344 aa		6.72	□□□□□ -1.33
KIFC1-213	ENST00000486695	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695		A0A1B0GUT8	65 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695		A0A1B0GW15	77 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	C7orf71	A4D174	169 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	SNURFL	B1AK76	121 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695		F2Z2F3	143 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	S100A6	P06703	90 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	CAMP	P49913	170 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HBB	P68871	147 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	PRR9	Q5T870	116 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	ZFP82	Q8N141	532 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	KCNS1	Q96KK3	526 aa		6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695		A8MTW9	85 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	WIPF1	O43516	503 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HLA-DQA1	P01909	254 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	AMBP	P02760	352 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	IGLC6	P0CF74	106 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	ZNF124	Q15973	351 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	AMTN	Q6UX39	209 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	STH	Q8IWL8	128 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		6.7	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695		A0A1B0GXF2	115 aa		6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695		M0R2Z0	102 aa		6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	APCS	P02743	223 aa		6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	TRGC1	P0CF51	173 aa		6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	ASIP	P42127	132 aa		6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	KIR3DS1	Q14943	382 aa		6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	MUC21	Q5SSG8	566 aa		6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		6.69	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	CD7	P09564	240 aa		6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	MED14OS	P0DP75	135 aa		6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	CTRL	P40313	264 aa		6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	FXYD7	P58549	80 aa		6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	CACNG7	P62955	275 aa		6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	TWIST1	Q15672	202 aa		6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		6.68	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	PHOX2A	O14813	284 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	GNRH2	O43555	120 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST1H2BK	O60814	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	INS	P01308	110 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	OR5AL1	P0C617	328 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST1H2BO	P23527	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST1H2BB	P33778	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	NDUFA6	P56556	154 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST1H2BD	P58876	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	SST	P61278	116 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST1H2BC	P62807	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695		Q6ZQT7	251 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		6.66	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		6.66	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		6.66	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695		H3BVH4	76 aa		6.66	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	SNAI2	O43623	268 aa		6.66	□□□□□ -1.34
KIFC1-213	ENST00000486695	IGLL1	P15814	213 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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