RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 PGPA6NDG6 321 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 INAFM2P0DMQ5 153 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 H2BFSP57053 126 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 TIRAPP58753 221 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 KCNS1Q96KK3 526 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-215ENST00000484986 HERC1Q15751 4861 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP10-1P60331 282 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 A0A1W2PPV4 95 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 GNRH2O43555 120 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 MPC2O95563 127 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 GCSHP23434 173 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 TREM1Q9NP99 234 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 SSNA1O43805 119 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 PPT1P50897 306 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 Q5VSD8 79 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 PSCAO43653 123 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 PTTG1O95997 202 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 CIDEAO60543 219 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 TYMSP04818 313 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 ASB13Q8WXK3 278 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRN-215ENST00000484986 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 F6UZH7 168 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF876PQ49A33 203 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 TVP23CQ96ET8 276 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.87□□□□□ -0.03
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PTPRN-215ENST00000484986 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 FAM229AH3BQW9 127 aa14.86□□□□□ -0.03
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PTPRN-215ENST00000484986 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 WFDC1Q9HC57 220 aa14.86□□□□□ -0.03
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PTPRN-215ENST00000484986 TAAR5O14804 337 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 RAB2AP61019 212 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 GNG5P63218 68 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 RGS21Q2M5E4 152 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 ALG5Q9Y673 324 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 RS1O15537 224 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN-215ENST00000484986 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 LELP1Q5T871 98 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 TCRAP04437 139 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 ZFP69Q49AA0 526 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 Q8N814 137 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 PTH2Q96A98 100 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 SGK494Q96LW2 274 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 Q9HAA7 133 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 GCGP01275 180 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 STAG3L2P0CL84 134 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 STAG3L3P0CL85 134 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 LAGE3Q14657 143 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 MED28Q9H204 178 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 C9orf85Q96MD7 179 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 TM2D2Q9BX73 214 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 PSG8Q9UQ74 426 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 IGHV3-30P01768 117 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 IGHV3-33P01772 117 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 MBP02144 154 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 SMUG1Q53HV7 270 aa14.79□□□□□ -0.04
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