RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 BMI1P35226 326 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 CEBPGP53567 150 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB131AP59861 70 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PAFAH1B2P68402 229 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 GUK1Q16774 197 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 CLLU1Q5K131 121 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 LCN12Q6JVE5 192 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF738Q8NE65 137 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf48Q96LS8 159 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 GPR82Q96P67 336 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ANK2Q01484 3957 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 OR4C46A6NHA9 309 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 C9JQL5 133 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf94C9JXX5 98 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ISLRO14498 428 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 BCL2P10415 239 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ID1P41134 155 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PSMB3P49720 205 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 XGP55808 180 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 FXYD7P58549 80 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PSG9Q00887 426 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ERCC8Q13216 396 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PSG3Q16557 428 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZVQ6 151 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 COMMD7Q86VX2 200 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB125Q8N687 156 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SUN5Q8TC36 379 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SLC50A1Q9BRV3 221 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 OTORQ9NRC9 128 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RNF24Q9Y225 148 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PRE2 83 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RAB19A4D1S5 217 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 OR11H12B2RN74 326 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 IFNA1P01562 189 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 CD5P06127 495 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 MEOX2P50222 304 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 INSL3P51460 131 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PDE6HQ13956 83 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PRNTQ86SH4 94 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 Q8TAT8 98 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 FAM210AQ96ND0 272 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 DERL1Q9BUN8 251 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TREM1Q9NP99 234 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 MANBALQ9NQG1 85 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 MED9Q9NWA0 146 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 VAX2Q9UIW0 290 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 EPDR1Q9UM22 224 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0J9YX75 114 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00862A6NCI5 91 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PEX7O00628 323 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF253O75346 499 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TCRAP04437 139 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SRP19P09132 144 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 CT45A10P0DMU9 189 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 CSN1S1P47710 185 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PPT1P50897 306 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZQT7 251 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 C5orf17Q8NAS9 161 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TPPP3Q9BW30 176 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV2A0A0B4J234 112 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 F6UZH7 168 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 H3BMM0 161 aa3.41□□□□□ -1.86
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