RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 A0A0G2JLM5 398 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 GAGE12BA1L429 117 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 J3KRW8 73 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 PLNP26678 52 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 LY6EQ16553 131 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 CCL19Q99731 98 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 A0A087WX48 190 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 H3BUT2 72 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 K7EMI3 77 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 SOCS3O14543 225 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 TRBV12-3P01733 135 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 PF4V1P10720 104 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 CLEC2AQ6UVW9 174 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM160Q9NX00 188 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 A6NDX4 124 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 GPHB5Q86YW7 130 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 C20orf78Q9BR46 151 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 H3BUX3 64 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 M0R381 172 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 SMIM13P0DJ93 91 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 SLC25A16P16260 332 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 PCP4P48539 62 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 Q6ZQT7 251 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 PPP1R17O96001 155 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 IGHV3-11P01762 117 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 GCSHP23434 173 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 RNF151Q2KHN1 245 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-218ENST00000482056 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.65□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 K7EP34 96 aa11.65□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 K7ERU9 68 aa11.65□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa11.65□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.65□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 RAB37Q96AX2 223 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 CSMD1Q96PZ7 3565 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 H7C1H1 209 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 A0A1W2PPM0 123 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 FABP2P12104 132 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 ID1P41134 155 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 JMJD8Q96S16 334 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 AKAP6Q13023 2319 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 MGPP08493 103 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 TM4SF20Q53R12 229 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 RASL10AQ92737 203 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 TOMM6Q96B49 74 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 KLK15Q9H2R5 256 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 F8VRH5 84 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 IGLV1-40P01703 118 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 MSMBP08118 114 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 ATP5J2P56134 94 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 TAL2Q16559 108 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 VPS25Q9BRG1 176 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 CEND1Q8N111 149 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 K7EMT4 169 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 TM2D2Q9BX73 214 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 SPCS1Q9Y6A9 102 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.59□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 FXYD2P54710 66 aa11.59□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 BLCAPP62952 87 aa11.59□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 F6UB75 175 aa11.59□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF580Q9UK33 172 aa11.59□□□□□ -0.55
C9orf3-218ENST00000482056 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.58□□□□□ -0.56
C9orf3-218ENST00000482056 LINC01549A6NIU2 74 aa11.58□□□□□ -0.56
C9orf3-218ENST00000482056 GNRH2O43555 120 aa11.58□□□□□ -0.56
C9orf3-218ENST00000482056 DEFB1P60022 68 aa11.58□□□□□ -0.56
C9orf3-218ENST00000482056 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms