RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-204	ENST00000481204	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204		A8MWL6	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204		K7EQG2	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	CCL24	O00175	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	SPRY2	O43597	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	NDUFA7	O95182	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	S100A6	P06703	90 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	CAMP	P49913	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	PROK1	P58294	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204		A0A1B0GXF2	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204		F2Z2F3	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	OVOL1	O14753	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TCF21	O43680	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	NUPR1	O60356	82 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	CRLF1	O75462	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	ORM1	P02763	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	ID1	P41134	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	AKR1D1	P51857	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	SLA	Q13239	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	CUBN	O60494	3623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	F8	P00451	2351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204		M0QZ24	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	APCS	P02743	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	BMI1	P35226	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204		A0A0J9YX75	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	GPX1	P07203	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	SRI	P30626	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	FXYD7	P58549	80 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	DEFB131A	P59861	70 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	HBB	P68871	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204		A0A1B0GUT8	65 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204		A8MZ25	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204		M0R2Z0	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	GNRH2	O43555	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKAP2-204	ENST00000481204	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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