RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475304.5

TAPBP-238, Transcript of TAP binding protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TAPBP, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAPBP-238	ENST00000475304	IGLV1-51	P01701	117 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	OR5AL1	P0C617	328 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	DEFB1	P60022	68 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	PRR9	Q5T870	116 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	CACNG7	P62955	275 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304		Q0VG73	95 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	TPPP3	Q9BW30	176 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	SNAI2	O43623	268 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	CD33	P20138	364 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	INSL3	P51460	131 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	CITED1	Q99966	193 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304		H3BMM0	161 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	SLA	Q13239	276 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	AMBP	P02760	352 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	ASIP	P42127	132 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	TDRG1	Q3Y452	100 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	AMTN	Q6UX39	209 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF575	Q86XF7	245 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	OR11H12	B2RN74	326 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304		J3KRW8	73 aa		12.83	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	S100A2	P29034	98 aa		12.83	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		12.83	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		12.83	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	NAGK	Q9UJ70	344 aa		12.83	□□□□□ -0.35
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	NTF3	P20783	257 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	SRI	P30626	198 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	TWIST1	Q15672	202 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	MDFI	Q99750	246 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	KNCN	A6PVL3	124 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	IGKV3-20	P01619	116 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	ESD	P10768	282 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	BAGE3	Q86Y29	109 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	AGRN	O00468	2067 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	STH	Q8IWL8	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304		H3BVH4	76 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304		M0R2Z0	102 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	AKR1D1	P51857	326 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM18	Q96B42	140 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	PPBP	P02775	128 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	KIR3DS1	Q14943	382 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	MUC21	Q5SSG8	566 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TAPBP-238	ENST00000475304	ATR	Q13535	2644 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	CD7	P09564	240 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304		Q6ZQT7	251 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	SORL1	Q92673	2214 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	INS	P01308	110 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	ORMDL3	Q8N138	153 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	NXPH4	O95158	308 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304		U3KQK5	164 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TAPBP-238	ENST00000475304	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37

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