RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.86□□□□□ -1.31
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DDX39B-211ENST00000449757 GNRH2O43555 120 aa6.86□□□□□ -1.31
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DDX39B-211ENST00000449757 TYMSP04818 313 aa6.86□□□□□ -1.31
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DDX39B-211ENST00000449757 TM2D2Q9BX73 214 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-211ENST00000449757 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-211ENST00000449757 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.86□□□□□ -1.31
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DDX39B-211ENST00000449757 GAGE12JA6NER3 117 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 GGTLC3B5MD39 225 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 GAGE1Q13065 139 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 GAGE4Q13068 117 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 GAGE5Q13069 117 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 GAGE13Q4V321 117 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.8□□□□□ -1.32
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DDX39B-211ENST00000449757 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.8□□□□□ -1.32
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DDX39B-211ENST00000449757 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 CIDEAO60543 219 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 ZFP69Q49AA0 526 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 RMI2Q96E14 147 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 TVP23CQ96ET8 276 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PPV4 95 aa6.78□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.78□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.78□□□□□ -1.32
DDX39B-211ENST00000449757 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-211ENST00000449757 H0YIZ8 118 aa6.77□□□□□ -1.33
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