RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 PLP1P60201 277 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 GAGE2BQ13066 116 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 LAGE3Q14657 143 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 NEDD8Q15843 81 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 GAGE2EQ4V326 116 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 Q6ZRU5 148 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 OR4C5Q8NGB2 326 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 OR52I2Q8NH67 350 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 SPXQ9BT56 116 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 ARV1Q9H2C2 271 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 NPVFQ9HCQ7 196 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 GPR132Q9UNW8 380 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 C5orf52A6NGY3 159 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 PRAC2D3DTV9 90 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 COX7A2P2O60397 106 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 HPGDSO60760 199 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 SFTA3P0C7M3 94 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 AKAIN1P0CW23 69 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 SLC25A6P12236 298 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 AMTP48728 403 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 DEFA1P59665 94 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 DEFA3P59666 94 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 RAB14P61106 215 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 LSM3P62310 102 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 CD300CQ08708 224 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 RAB31Q13636 194 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 OPCMLQ14982 345 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 LINC01620Q4KN68 170 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 C14orf177Q52M58 125 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 Q6ZRG5 221 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 Q75L30 129 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 STX12Q86Y82 276 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 TCTE3Q8IZS6 198 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 BAALCQ8WXS3 180 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 AP3S1Q92572 193 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 YIPF6Q96EC8 236 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 ZNF479Q96JC4 524 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 PRADC1Q9BSG0 188 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 PAXXQ9BUH6 204 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 SRRQ9GZT4 340 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 MED9Q9NWA0 146 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.37□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 KLLNB2CW77 178 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 H3BTX0 84 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 UPK1BO75841 260 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 CCNKO75909 580 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 OR4E1P0C645 316 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 RAB4BP61018 213 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 BTN1A1Q13410 526 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 ZFP69Q49AA0 526 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 LELP1Q5T871 98 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 ZNF546Q86UE3 836 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 NRACQ8N912 160 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 THAP6Q8TBB0 222 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 RASL10AQ92737 203 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 C2orf50Q96LR7 162 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 CCDC32Q9BV29 185 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 PSENENQ9NZ42 101 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.36□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 RNF213Q63HN8 5207 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 TRAV4A0A0B4J268 109 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 RNF222A6NCQ9 220 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 F8W036 122 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 H3BP45 60 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 CIDEAO60543 219 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 PITX3O75364 302 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 IL7P13232 177 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms