RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZTI0 123 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 FMC1Q96HJ9 113 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 SPXQ9BT56 116 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1B0GV50 99 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 F5H768 121 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 CCL20P78556 96 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM183BQ1AE95 376 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 MANBALQ9NQG1 85 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 MDFICQ9P1T7 246 aa11.87□□□□□ -0.51
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RABGEF1-204ENST00000442563 GNRH2O43555 120 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 Q86TA4 180 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 NAGKQ9UJ70 344 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 AKR1C3P42330 323 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2G1P62253 170 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 RASL10AQ92737 203 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 GNG13Q9P2W3 67 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 LTAP01374 205 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 TYMSP04818 313 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 P0DMU3 169 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM231AP0DMU4 169 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM231CP0DMU5 169 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 SCO2A0A1W2PP80 73 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BNG1 76 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 M0R2P5 195 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXA5P20719 270 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 CRIP1P50238 77 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5I1Q13606 314 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 IFNA1P01562 189 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 BLOC1S1P78537 153 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 ALKAL2Q6UX46 152 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf52Q96A22 123 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 SLAQ13239 276 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 PTH2Q96A98 100 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.8□□□□□ -0.52
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RABGEF1-204ENST00000442563 RNF212Q495C1 297 aa11.79□□□□□ -0.52
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RABGEF1-204ENST00000442563 VAX2Q9UIW0 290 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 PDE6DO43924 150 aa11.78□□□□□ -0.52
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RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM12Q96EX1 92 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF479Q96JC4 524 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 C9JCJ5 164 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 PAX4O43316 350 aa11.73□□□□□ -0.53
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