RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 PET117Q6UWS5 81 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF738Q8NE65 137 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 CITED1Q99966 193 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 CKS2P33552 79 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 ID1P41134 155 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP10-3P60369 221 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 TWIST1Q15672 202 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 LY6EQ16553 131 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSMG4Q5JS54 123 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q8TAT8 98 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRELID3AQ96N28 172 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNFNQ9BYD5 112 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 ST20Q9HBF5 79 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 U3KQE9 123 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 D6R8Y8 96 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLC6P0CF74 106 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRIP1P50238 77 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM106AQ4KMX7 169 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q6ZN92 141 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 GLMPQ8WWB7 406 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00477Q96M19 166 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 UFC1Q9Y3C8 167 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 TENM3Q9P273 2699 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR4C46A6NHA9 309 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 G3V4G9 280 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 HBDP02042 147 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSN3P07498 182 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF182Q8N6D2 247 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR4X2Q8NGF9 303 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 VGLL1Q99990 258 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 U3KQK5 164 aa4.81□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 C2orf70A6NJV1 201 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7EMT4 169 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV1-40P01703 118 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLC3P0DOY3 106 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 MED14OSP0DP75 135 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXE3Q13461 319 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 AMN1Q8IY45 258 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q8N976 141 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIFOQ8TCI5 191 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRAPQ8TCY5 172 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 RYR2Q92736 4967 aa4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP1R17O96001 155 aa4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHG4P01861 327 aa4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 HLA-DMBP28068 263 aa4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRAP2Q96G30 205 aa4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 VPREB3Q9UKI3 123 aa4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GV90 55 aa4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM213A2RRL7 107 aa4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC01549A6NIU2 74 aa4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC01548A6NM66 108 aa4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7EMI3 77 aa4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELANEP08246 267 aa4.78□□□□□ -1.64
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASIPP42127 132 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms