RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP6V0BQ99437 205 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMPXQ9UHP9 88 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOTCH2Q04721 2471 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DEFB136Q30KP8 78 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SYNJ2BPP57105 145 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C18orf15Q96N68 181 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 U3KQK5 164 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF747Q9BV97 191 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF688P0C7X2 276 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DUX3Q96PT4 197 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GNRH2O43555 120 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CNFNQ9BYD5 112 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A087WW49 117 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 J3QLI3 93 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TNFRSF6BO95407 300 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 G0S2P27469 103 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q6YL49 198 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF702PQ9H963 129 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AKAP9Q99996 3911 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SNAI2O43623 268 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCF21O43680 179 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BRI3O95415 125 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00477Q96M19 166 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C20orf202A1L168 122 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OVOL1O14753 267 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSMG4Q5JS54 123 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TSPOP30536 169 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DCANP1Q8TF63 244 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MUC4Q99102 2169 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CACNG7P62955 275 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FSHBP01225 129 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PET117Q6UWS5 81 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q6ZVH6 145 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCAPO15273 167 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HBDP02042 147 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LEPP41159 167 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STPG4Q8N801 248 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLURP1P55000 103 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC01545Q5VT33 79 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 JMJD1CQ15652 2540 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDZD2O15018 2839 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 K7EMT4 169 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MGPP08493 103 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ASIPP42127 132 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 JPT2Q9H910 190 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM158Q8WZ71 300 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.48□□□□□ -0.89
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