RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368530.6

TPM3-210, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPM3, Length 1,523 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-210ENST00000368530 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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TPM3-210ENST00000368530 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.39□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.39□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.39□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.39□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.39□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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TPM3-210ENST00000368530 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.38□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.38□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 GTSF1Q8WW33 167 aa7.38□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.38□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 TMEM189A5PLL7 270 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 SNURFLB1AK76 121 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 ID1P41134 155 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 CT83Q5H943 113 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 DCANP1Q8TF63 244 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 TPPP3Q9BW30 176 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 C5orf52A6NGY3 159 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 ZNF688P0C7X2 276 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 CAMPP49913 170 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 SPATA25Q9BR10 227 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 PEMTQ9UBM1 199 aa7.37□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.36□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 ORM1P02763 201 aa7.36□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 CSN3P07498 182 aa7.36□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 AKR1D1P51857 326 aa7.36□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 PSMG4Q5JS54 123 aa7.36□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.36□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 WDR73Q6P4I2 378 aa7.36□□□□□ -1.23
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TPM3-210ENST00000368530 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.36□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.36□□□□□ -1.23
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TPM3-210ENST00000368530 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.36□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 AGRNO00468 2067 aa7.35□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 XKRY2A2RUG3 117 aa7.35□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.35□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 K7EQG2 157 aa7.35□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 SSTP61278 116 aa7.35□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.35□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.35□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 PRR9Q5T870 116 aa7.35□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.35□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 Q6ZQT7 251 aa7.35□□□□□ -1.23
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TPM3-210ENST00000368530 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.34□□□□□ -1.23
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TPM3-210ENST00000368530 UBE2CO00762 179 aa7.34□□□□□ -1.23
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TPM3-210ENST00000368530 MUC21Q5SSG8 566 aa7.34□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.34□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 LINC00477Q96M19 166 aa7.34□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 RETNQ9HD89 108 aa7.34□□□□□ -1.23
TPM3-210ENST00000368530 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.33□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 FAM231BA6NCW3 169 aa7.33□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 IGKV3-20P01619 116 aa7.33□□□□□ -1.24
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TPM3-210ENST00000368530 MT-ND6P03923 174 aa7.33□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.33□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 PAFAH1B2P68402 229 aa7.33□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 HBBP68871 147 aa7.33□□□□□ -1.24
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TPM3-210ENST00000368530 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.33□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.33□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.33□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 NAGKQ9UJ70 344 aa7.33□□□□□ -1.24
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TPM3-210ENST00000368530 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 BORCS7Q96B45 105 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 A0A1B0GUT8 65 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 GPX1P07203 203 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 RIGQ13278 110 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-210ENST00000368530 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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