RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 IQCJQ1A5X6 159 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAMD13Q5VXD3 122 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOMM20LQ6UXN7 152 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC115Q96NT0 180 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANK1P16157 1881 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-78P-201ENST00000362897 MDN1Q9NU22 5596 aa0.15□□□□□ -2.38
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCA4P78363 2273 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCKP06307 115 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 S100GP29377 79 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 ESPL1Q14674 2120 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 OTOSQ8NHW6 89 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRPM7Q96QT4 1865 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 F8P00451 2351 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCORL1Q5H9F3 1711 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCBD1P61457 104 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLKP1Q107X0 134 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM14BQ9NUH8 114 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC28Q96AY4 2481 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD3DP04234 171 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCRAP04437 139 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDC4P31431 198 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS28P62857 69 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSPHP78330 225 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMIM15Q7Z3B0 74 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 SELENOSQ9BQE4 189 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDA1Q9BW61 102 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP54Q70EL1 1684 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSTD3H0UI37 97 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADCYAP1P18509 176 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q5XG85 94 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4S1Q8NGB4 309 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANK2Q01484 3957 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLQO75417 2590 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 MED23Q9ULK4 1368 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A096LNT2 108 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPM2O94777 84 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSD17B12Q53GQ0 312 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 CALML5Q9NZT1 146 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 MED13LQ71F56 2210 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPDO75976 1380 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAV17A0A0B4J275 112 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 J3KT08 172 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOC1P02654 83 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAEPP09466 180 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPC1LP0DKB6 136 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 VMO1Q7Z5L0 202 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR8I2Q8N0Y5 310 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS25Q9BRG1 176 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 COA4Q9NYJ1 87 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSPB11Q9Y547 144 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYH1P12882 1939 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMIM24O75264 130 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2H2O95918 312 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 MT-ND4LP03901 98 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLGLB1Q02325 96 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM244Q5VVB8 128 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A26Q70HW3 274 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPDPFLQ8WWR9 84 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM141Q96I45 108 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSCR8Q96T75 97 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 PROK2Q9HC23 129 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 GINS2Q9Y248 185 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFAF1Q9Y375 327 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 CADP27708 2225 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 PBRM1Q86U86 1689 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPRGP23470 1445 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASXL3Q9C0F0 2248 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9JAW5 83 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM91Q6ZNR0 172 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 BET1LQ9NYM9 111 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS2R8Q9NYW2 309 aa0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms