RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A22Q9H936 323 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZNF702PQ9H963 129 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 C9orf118A6NHY6 69 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-23P01764 117 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CFHR3Q02985 330 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PMCHL1Q16048 86 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 BRK1Q8WUW1 75 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 H3BUA1 57 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 VPREB1P12018 145 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CCL20P78556 96 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 WFDC2Q14508 124 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 C15orf32Q32M92 178 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ABCA1O95477 2261 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 A0A087X0K7 114 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 FAM223BA6NKX1 122 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 F8W735 103 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CSN1S1P47710 185 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 XGP55808 180 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SPRY2O43597 315 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 IGLV1-40P01703 118 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TRGV3P03979 118 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SRD5A1P18405 259 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 IMMP2LQ96T52 175 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 KIR2DL4Q99706 377 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 MXRA5Q9NR99 2828 aa4.69□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SERF1AO75920 110 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 HERVK_113P63121 156 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 Q8N2B8 174 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 OR4F5Q8NH21 305 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ESM1Q9NQ30 184 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 COX7A2P2O60397 106 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1-17P01599 117 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PMVKQ15126 192 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SAMD5Q5TGI4 173 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 Q6AWC8 147 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PATE2Q6UY27 113 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CCDC140Q96MF4 163 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PRELID3AQ96N28 172 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 JPT2Q9H910 190 aa4.68□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CHEK1O14757 476 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 GPR183P32249 361 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SEC11AP67812 179 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 LCN12Q6JVE5 192 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TM2D2Q9BX73 214 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.67□□□□□ -1.66
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CCR6-201ENST00000341935 IGHG4P01861 327 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CTSGP08311 255 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TAS2R45P59539 299 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 LYZP61626 148 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 GAGE13Q4V321 117 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 USMG5Q96IX5 58 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 U3KQE9 123 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CREBBPQ92793 2442 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZNF329Q86UD4 541 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 C2orf48Q96LS8 159 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 KLK15Q9H2R5 256 aa4.67□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PPM0 123 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 FAM181BA6NEQ2 426 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 MGST1P10620 155 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PSMB8P28062 276 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ADMP35318 185 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 LINC01620Q4KN68 170 aa4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.66□□□□□ -1.66
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